Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21887J3QQ04 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21887J3QQ04 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21887J3QQ04 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21887J3QQ04 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21887J3QQ04 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21887J3QQ04 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21887J3QQ04 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21887J3QQ04 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21887J3QQ04 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21887J3QQ04 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm21887J3QQ04 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm21887J3QQ04 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm21887J3QQ04 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm21887J3QQ04 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm21887J3QQ04 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm21887J3QQ04 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm21887J3QQ04 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm21887J3QQ04 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21887J3QQ04 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21887J3QQ04 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21887J3QQ04 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21887J3QQ04 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21887J3QQ04 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21887J3QQ04 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm21887J3QQ04 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm21887J3QQ04 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm21887J3QQ04 Gm29151-201ENSMUST00000196669 2513 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm21887J3QQ04 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm21887J3QQ04 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm21887J3QQ04 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm21887J3QQ04 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm21887J3QQ04 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm21887J3QQ04 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm21887J3QQ04 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm21887J3QQ04 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm21887J3QQ04 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm21887J3QQ04 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm21887J3QQ04 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm21887J3QQ04 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm21887J3QQ04 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm21887J3QQ04 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm21887J3QQ04 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm21887J3QQ04 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm21887J3QQ04 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm21887J3QQ04 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm21887J3QQ04 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm21887J3QQ04 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm21887J3QQ04 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm21887J3QQ04 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm21887J3QQ04 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm21887J3QQ04 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm21887J3QQ04 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm21887J3QQ04 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm21887J3QQ04 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm21887J3QQ04 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm21887J3QQ04 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm21887J3QQ04 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm21887J3QQ04 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm21887J3QQ04 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm21887J3QQ04 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm21887J3QQ04 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm21887J3QQ04 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm21887J3QQ04 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm21887J3QQ04 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm21887J3QQ04 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm21887J3QQ04 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm21887J3QQ04 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21887J3QQ04 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21887J3QQ04 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21887J3QQ04 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21887J3QQ04 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21887J3QQ04 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21887J3QQ04 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21887J3QQ04 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21887J3QQ04 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21887J3QQ04 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21887J3QQ04 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm21887J3QQ04 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm21887J3QQ04 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm21887J3QQ04 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm21887J3QQ04 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm21887J3QQ04 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm21887J3QQ04 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm21887J3QQ04 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm21887J3QQ04 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm21887J3QQ04 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm21887J3QQ04 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm21887J3QQ04 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm21887J3QQ04 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm21887J3QQ04 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm21887J3QQ04 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm21887J3QQ04 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm21887J3QQ04 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm21887J3QQ04 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm21887J3QQ04 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm21887J3QQ04 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21887J3QQ04 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21887J3QQ04 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21887J3QQ04 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.4 ms