Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm2056J3QQ02 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm2056J3QQ02 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm2056J3QQ02 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm2056J3QQ02 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm2056J3QQ02 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm2056J3QQ02 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm2056J3QQ02 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm2056J3QQ02 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm2056J3QQ02 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm2056J3QQ02 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm2056J3QQ02 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm2056J3QQ02 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm2056J3QQ02 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm2056J3QQ02 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm2056J3QQ02 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm2056J3QQ02 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm2056J3QQ02 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm2056J3QQ02 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm2056J3QQ02 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm2056J3QQ02 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm2056J3QQ02 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm2056J3QQ02 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm2056J3QQ02 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm2056J3QQ02 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm2056J3QQ02 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm2056J3QQ02 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm2056J3QQ02 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm2056J3QQ02 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm2056J3QQ02 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm2056J3QQ02 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm2056J3QQ02 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm2056J3QQ02 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm2056J3QQ02 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm2056J3QQ02 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm2056J3QQ02 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm2056J3QQ02 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm2056J3QQ02 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm2056J3QQ02 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm2056J3QQ02 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm2056J3QQ02 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm2056J3QQ02 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Gm2056J3QQ02 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm2056J3QQ02 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm2056J3QQ02 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm2056J3QQ02 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm2056J3QQ02 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm2056J3QQ02 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm2056J3QQ02 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm2056J3QQ02 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm2056J3QQ02 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm2056J3QQ02 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm2056J3QQ02 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm2056J3QQ02 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm2056J3QQ02 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm2056J3QQ02 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm2056J3QQ02 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm2056J3QQ02 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm2056J3QQ02 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm2056J3QQ02 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm2056J3QQ02 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm2056J3QQ02 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm2056J3QQ02 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm2056J3QQ02 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm2056J3QQ02 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm2056J3QQ02 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm2056J3QQ02 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm2056J3QQ02 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm2056J3QQ02 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm2056J3QQ02 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm2056J3QQ02 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm2056J3QQ02 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm2056J3QQ02 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm2056J3QQ02 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm2056J3QQ02 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm2056J3QQ02 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm2056J3QQ02 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm2056J3QQ02 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm2056J3QQ02 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm2056J3QQ02 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm2056J3QQ02 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm2056J3QQ02 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm2056J3QQ02 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm2056J3QQ02 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm2056J3QQ02 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm2056J3QQ02 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm2056J3QQ02 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm2056J3QQ02 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm2056J3QQ02 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm2056J3QQ02 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm2056J3QQ02 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm2056J3QQ02 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm2056J3QQ02 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm2056J3QQ02 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm2056J3QQ02 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm2056J3QQ02 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm2056J3QQ02 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm2056J3QQ02 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm2056J3QQ02 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm2056J3QQ02 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms