Protein–RNA interactions for Protein: J3QPP8

Alkal1, ALK and LTK ligand 1, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkal1J3QPP8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Alkal1J3QPP8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Alkal1J3QPP8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Alkal1J3QPP8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Alkal1J3QPP8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Alkal1J3QPP8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Alkal1J3QPP8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Alkal1J3QPP8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Alkal1J3QPP8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Alkal1J3QPP8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Alkal1J3QPP8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Alkal1J3QPP8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Alkal1J3QPP8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Alkal1J3QPP8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Alkal1J3QPP8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Alkal1J3QPP8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Alkal1J3QPP8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Alkal1J3QPP8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Alkal1J3QPP8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Alkal1J3QPP8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Alkal1J3QPP8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Alkal1J3QPP8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Alkal1J3QPP8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Alkal1J3QPP8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Alkal1J3QPP8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Alkal1J3QPP8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Alkal1J3QPP8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Alkal1J3QPP8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Alkal1J3QPP8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Alkal1J3QPP8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Alkal1J3QPP8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Alkal1J3QPP8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Alkal1J3QPP8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Alkal1J3QPP8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Alkal1J3QPP8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Alkal1J3QPP8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Alkal1J3QPP8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Alkal1J3QPP8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Alkal1J3QPP8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Alkal1J3QPP8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Alkal1J3QPP8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Alkal1J3QPP8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Alkal1J3QPP8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Alkal1J3QPP8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Alkal1J3QPP8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Alkal1J3QPP8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Alkal1J3QPP8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Alkal1J3QPP8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Alkal1J3QPP8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Alkal1J3QPP8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Alkal1J3QPP8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Alkal1J3QPP8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Alkal1J3QPP8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Alkal1J3QPP8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Alkal1J3QPP8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Alkal1J3QPP8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Alkal1J3QPP8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Alkal1J3QPP8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Alkal1J3QPP8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Alkal1J3QPP8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Alkal1J3QPP8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Alkal1J3QPP8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Alkal1J3QPP8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Alkal1J3QPP8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Alkal1J3QPP8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Alkal1J3QPP8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Alkal1J3QPP8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Alkal1J3QPP8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Alkal1J3QPP8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Alkal1J3QPP8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Alkal1J3QPP8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Alkal1J3QPP8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Alkal1J3QPP8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Alkal1J3QPP8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Alkal1J3QPP8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Alkal1J3QPP8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Alkal1J3QPP8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Alkal1J3QPP8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Alkal1J3QPP8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Alkal1J3QPP8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Alkal1J3QPP8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Alkal1J3QPP8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Alkal1J3QPP8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Alkal1J3QPP8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Alkal1J3QPP8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Alkal1J3QPP8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Alkal1J3QPP8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Alkal1J3QPP8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Alkal1J3QPP8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Alkal1J3QPP8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Alkal1J3QPP8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Alkal1J3QPP8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Alkal1J3QPP8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Alkal1J3QPP8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Alkal1J3QPP8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Alkal1J3QPP8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Alkal1J3QPP8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Alkal1J3QPP8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Alkal1J3QPP8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Alkal1J3QPP8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms