Protein–RNA interactions for Protein: J3QP80

Gm5814, MCG15559, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5814J3QP80 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm5814J3QP80 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gm5814J3QP80 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm5814J3QP80 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm5814J3QP80 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm5814J3QP80 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm5814J3QP80 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm5814J3QP80 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm5814J3QP80 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm5814J3QP80 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm5814J3QP80 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm5814J3QP80 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm5814J3QP80 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm5814J3QP80 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm5814J3QP80 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm5814J3QP80 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm5814J3QP80 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm5814J3QP80 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm5814J3QP80 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm5814J3QP80 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm5814J3QP80 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm5814J3QP80 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm5814J3QP80 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm5814J3QP80 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm5814J3QP80 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm5814J3QP80 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm5814J3QP80 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm5814J3QP80 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm5814J3QP80 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm5814J3QP80 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm5814J3QP80 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm5814J3QP80 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm5814J3QP80 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm5814J3QP80 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm5814J3QP80 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm5814J3QP80 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm5814J3QP80 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm5814J3QP80 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm5814J3QP80 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm5814J3QP80 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm5814J3QP80 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm5814J3QP80 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm5814J3QP80 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm5814J3QP80 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm5814J3QP80 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm5814J3QP80 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm5814J3QP80 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm5814J3QP80 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm5814J3QP80 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm5814J3QP80 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm5814J3QP80 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm5814J3QP80 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm5814J3QP80 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm5814J3QP80 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm5814J3QP80 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm5814J3QP80 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm5814J3QP80 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm5814J3QP80 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm5814J3QP80 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm5814J3QP80 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm5814J3QP80 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm5814J3QP80 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gm5814J3QP80 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm5814J3QP80 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm5814J3QP80 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm5814J3QP80 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm5814J3QP80 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm5814J3QP80 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm5814J3QP80 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm5814J3QP80 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm5814J3QP80 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm5814J3QP80 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm5814J3QP80 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm5814J3QP80 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm5814J3QP80 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm5814J3QP80 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm5814J3QP80 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm5814J3QP80 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm5814J3QP80 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm5814J3QP80 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm5814J3QP80 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm5814J3QP80 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gm5814J3QP80 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm5814J3QP80 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm5814J3QP80 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm5814J3QP80 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm5814J3QP80 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm5814J3QP80 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm5814J3QP80 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm5814J3QP80 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm5814J3QP80 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm5814J3QP80 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm5814J3QP80 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm5814J3QP80 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm5814J3QP80 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm5814J3QP80 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm5814J3QP80 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm5814J3QP80 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm5814J3QP80 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm5814J3QP80 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms