Protein–RNA interactions for Protein: J3QJZ1

Gm21969, Predicted gene 21969, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21969J3QJZ1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gm21969J3QJZ1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gm21969J3QJZ1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gm21969J3QJZ1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gm21969J3QJZ1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gm21969J3QJZ1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gm21969J3QJZ1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gm21969J3QJZ1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gm21969J3QJZ1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gm21969J3QJZ1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gm21969J3QJZ1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gm21969J3QJZ1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gm21969J3QJZ1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gm21969J3QJZ1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gm21969J3QJZ1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gm21969J3QJZ1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gm21969J3QJZ1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gm21969J3QJZ1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Gm21969J3QJZ1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gm21969J3QJZ1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gm21969J3QJZ1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gm21969J3QJZ1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gm21969J3QJZ1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gm21969J3QJZ1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gm21969J3QJZ1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gm21969J3QJZ1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gm21969J3QJZ1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gm21969J3QJZ1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gm21969J3QJZ1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gm21969J3QJZ1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gm21969J3QJZ1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gm21969J3QJZ1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gm21969J3QJZ1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gm21969J3QJZ1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gm21969J3QJZ1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gm21969J3QJZ1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gm21969J3QJZ1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gm21969J3QJZ1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gm21969J3QJZ1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gm21969J3QJZ1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gm21969J3QJZ1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Gm21969J3QJZ1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gm21969J3QJZ1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gm21969J3QJZ1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gm21969J3QJZ1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gm21969J3QJZ1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gm21969J3QJZ1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gm21969J3QJZ1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gm21969J3QJZ1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gm21969J3QJZ1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gm21969J3QJZ1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gm21969J3QJZ1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gm21969J3QJZ1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Gm21969J3QJZ1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gm21969J3QJZ1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gm21969J3QJZ1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gm21969J3QJZ1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gm21969J3QJZ1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gm21969J3QJZ1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gm21969J3QJZ1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gm21969J3QJZ1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gm21969J3QJZ1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gm21969J3QJZ1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gm21969J3QJZ1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gm21969J3QJZ1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gm21969J3QJZ1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gm21969J3QJZ1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gm21969J3QJZ1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gm21969J3QJZ1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gm21969J3QJZ1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gm21969J3QJZ1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gm21969J3QJZ1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gm21969J3QJZ1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gm21969J3QJZ1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gm21969J3QJZ1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gm21969J3QJZ1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gm21969J3QJZ1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gm21969J3QJZ1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gm21969J3QJZ1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gm21969J3QJZ1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gm21969J3QJZ1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gm21969J3QJZ1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gm21969J3QJZ1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gm21969J3QJZ1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gm21969J3QJZ1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gm21969J3QJZ1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gm21969J3QJZ1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gm21969J3QJZ1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gm21969J3QJZ1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gm21969J3QJZ1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gm21969J3QJZ1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Gm21969J3QJZ1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Gm21969J3QJZ1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Gm21969J3QJZ1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gm21969J3QJZ1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gm21969J3QJZ1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gm21969J3QJZ1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gm21969J3QJZ1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gm21969J3QJZ1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gm21969J3QJZ1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms