Protein–RNA interactions for Protein: G5E8J6

Hrc, Histidine rich calcium binding protein, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 738 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HrcG5E8J6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
HrcG5E8J6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
HrcG5E8J6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
HrcG5E8J6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
HrcG5E8J6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.82■■■■□ 3.81
HrcG5E8J6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
HrcG5E8J6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
HrcG5E8J6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC38.82■■■■□ 3.8
HrcG5E8J6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
HrcG5E8J6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC38.79■■■■□ 3.8
HrcG5E8J6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
HrcG5E8J6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
HrcG5E8J6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.77■■■■□ 3.8
HrcG5E8J6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
HrcG5E8J6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
HrcG5E8J6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
HrcG5E8J6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
HrcG5E8J6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
HrcG5E8J6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79
HrcG5E8J6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
HrcG5E8J6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
HrcG5E8J6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC38.73■■■■□ 3.79
HrcG5E8J6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC38.73■■■■□ 3.79
HrcG5E8J6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
HrcG5E8J6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
HrcG5E8J6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
HrcG5E8J6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
HrcG5E8J6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
HrcG5E8J6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
HrcG5E8J6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
HrcG5E8J6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
HrcG5E8J6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
HrcG5E8J6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
HrcG5E8J6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
HrcG5E8J6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
HrcG5E8J6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
HrcG5E8J6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
HrcG5E8J6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC38.68■■■■□ 3.78
HrcG5E8J6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
HrcG5E8J6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC38.67■■■■□ 3.78
HrcG5E8J6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
HrcG5E8J6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
HrcG5E8J6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
HrcG5E8J6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
HrcG5E8J6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
HrcG5E8J6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
HrcG5E8J6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC38.63■■■■□ 3.77
HrcG5E8J6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
HrcG5E8J6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC38.62■■■■□ 3.77
HrcG5E8J6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
HrcG5E8J6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC38.62■■■■□ 3.77
HrcG5E8J6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
HrcG5E8J6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
HrcG5E8J6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
HrcG5E8J6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
HrcG5E8J6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
HrcG5E8J6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
HrcG5E8J6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
HrcG5E8J6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
HrcG5E8J6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
HrcG5E8J6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
HrcG5E8J6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.54■■■■□ 3.76
HrcG5E8J6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
HrcG5E8J6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
HrcG5E8J6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
HrcG5E8J6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
HrcG5E8J6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
HrcG5E8J6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
HrcG5E8J6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
HrcG5E8J6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
HrcG5E8J6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
HrcG5E8J6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
HrcG5E8J6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC38.45■■■■□ 3.75
HrcG5E8J6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
HrcG5E8J6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC38.44■■■■□ 3.74
HrcG5E8J6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
HrcG5E8J6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
HrcG5E8J6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
HrcG5E8J6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
HrcG5E8J6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
HrcG5E8J6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
HrcG5E8J6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
HrcG5E8J6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
HrcG5E8J6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC38.41■■■■□ 3.74
HrcG5E8J6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
HrcG5E8J6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
HrcG5E8J6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
HrcG5E8J6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
HrcG5E8J6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
HrcG5E8J6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
HrcG5E8J6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
HrcG5E8J6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC38.37■■■■□ 3.73
HrcG5E8J6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
HrcG5E8J6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
HrcG5E8J6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
HrcG5E8J6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC38.35■■■■□ 3.73
HrcG5E8J6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
HrcG5E8J6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
HrcG5E8J6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
HrcG5E8J6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms