Protein–RNA interactions for Protein: G3X9N5

Nxph4, Neurexophilin, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxph4G3X9N5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nxph4G3X9N5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Nxph4G3X9N5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nxph4G3X9N5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nxph4G3X9N5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nxph4G3X9N5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nxph4G3X9N5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nxph4G3X9N5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nxph4G3X9N5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nxph4G3X9N5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nxph4G3X9N5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nxph4G3X9N5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Nxph4G3X9N5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nxph4G3X9N5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nxph4G3X9N5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nxph4G3X9N5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nxph4G3X9N5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nxph4G3X9N5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nxph4G3X9N5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nxph4G3X9N5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nxph4G3X9N5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nxph4G3X9N5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nxph4G3X9N5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nxph4G3X9N5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nxph4G3X9N5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nxph4G3X9N5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nxph4G3X9N5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nxph4G3X9N5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nxph4G3X9N5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Nxph4G3X9N5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nxph4G3X9N5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nxph4G3X9N5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nxph4G3X9N5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nxph4G3X9N5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nxph4G3X9N5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nxph4G3X9N5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nxph4G3X9N5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nxph4G3X9N5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nxph4G3X9N5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nxph4G3X9N5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nxph4G3X9N5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Nxph4G3X9N5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Nxph4G3X9N5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nxph4G3X9N5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nxph4G3X9N5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nxph4G3X9N5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Nxph4G3X9N5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nxph4G3X9N5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nxph4G3X9N5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nxph4G3X9N5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nxph4G3X9N5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nxph4G3X9N5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nxph4G3X9N5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nxph4G3X9N5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nxph4G3X9N5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nxph4G3X9N5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Nxph4G3X9N5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nxph4G3X9N5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nxph4G3X9N5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nxph4G3X9N5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nxph4G3X9N5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nxph4G3X9N5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nxph4G3X9N5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nxph4G3X9N5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nxph4G3X9N5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nxph4G3X9N5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nxph4G3X9N5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nxph4G3X9N5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nxph4G3X9N5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nxph4G3X9N5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nxph4G3X9N5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nxph4G3X9N5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Nxph4G3X9N5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nxph4G3X9N5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Nxph4G3X9N5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nxph4G3X9N5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nxph4G3X9N5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nxph4G3X9N5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nxph4G3X9N5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nxph4G3X9N5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nxph4G3X9N5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nxph4G3X9N5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nxph4G3X9N5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nxph4G3X9N5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nxph4G3X9N5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nxph4G3X9N5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Nxph4G3X9N5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nxph4G3X9N5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nxph4G3X9N5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nxph4G3X9N5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nxph4G3X9N5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nxph4G3X9N5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nxph4G3X9N5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nxph4G3X9N5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nxph4G3X9N5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Nxph4G3X9N5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nxph4G3X9N5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nxph4G3X9N5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nxph4G3X9N5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nxph4G3X9N5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms