Protein–RNA interactions for Protein: G3X992

Msl3l2, MSL3-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl3l2G3X992 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Msl3l2G3X992 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Msl3l2G3X992 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Msl3l2G3X992 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Msl3l2G3X992 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Msl3l2G3X992 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Msl3l2G3X992 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Msl3l2G3X992 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Msl3l2G3X992 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Msl3l2G3X992 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Msl3l2G3X992 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Msl3l2G3X992 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Msl3l2G3X992 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Msl3l2G3X992 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Msl3l2G3X992 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Msl3l2G3X992 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Msl3l2G3X992 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Msl3l2G3X992 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Msl3l2G3X992 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Msl3l2G3X992 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Msl3l2G3X992 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Msl3l2G3X992 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Msl3l2G3X992 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Msl3l2G3X992 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Msl3l2G3X992 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Msl3l2G3X992 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Msl3l2G3X992 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Msl3l2G3X992 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Msl3l2G3X992 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Msl3l2G3X992 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Msl3l2G3X992 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Msl3l2G3X992 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Msl3l2G3X992 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Msl3l2G3X992 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Msl3l2G3X992 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Msl3l2G3X992 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Msl3l2G3X992 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Msl3l2G3X992 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Msl3l2G3X992 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Msl3l2G3X992 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Msl3l2G3X992 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Msl3l2G3X992 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Msl3l2G3X992 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Msl3l2G3X992 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Msl3l2G3X992 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Msl3l2G3X992 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Msl3l2G3X992 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Msl3l2G3X992 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Msl3l2G3X992 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Msl3l2G3X992 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Msl3l2G3X992 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Msl3l2G3X992 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Msl3l2G3X992 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Msl3l2G3X992 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Msl3l2G3X992 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Msl3l2G3X992 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Msl3l2G3X992 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Msl3l2G3X992 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Msl3l2G3X992 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Msl3l2G3X992 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Msl3l2G3X992 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Msl3l2G3X992 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Msl3l2G3X992 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Msl3l2G3X992 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Msl3l2G3X992 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Msl3l2G3X992 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Msl3l2G3X992 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Msl3l2G3X992 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Msl3l2G3X992 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Msl3l2G3X992 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Msl3l2G3X992 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Msl3l2G3X992 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Msl3l2G3X992 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Msl3l2G3X992 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Msl3l2G3X992 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Msl3l2G3X992 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Msl3l2G3X992 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Msl3l2G3X992 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Msl3l2G3X992 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Msl3l2G3X992 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Msl3l2G3X992 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Msl3l2G3X992 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Msl3l2G3X992 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Msl3l2G3X992 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Msl3l2G3X992 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Msl3l2G3X992 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Msl3l2G3X992 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Msl3l2G3X992 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Msl3l2G3X992 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Msl3l2G3X992 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msl3l2G3X992 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msl3l2G3X992 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msl3l2G3X992 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msl3l2G3X992 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msl3l2G3X992 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msl3l2G3X992 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msl3l2G3X992 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msl3l2G3X992 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Msl3l2G3X992 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Msl3l2G3X992 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.7 ms