Protein–RNA interactions for Protein: G3X952

Zkscan2, MCG20985, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan2G3X952 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Zkscan2G3X952 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Zkscan2G3X952 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Zkscan2G3X952 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Zkscan2G3X952 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Zkscan2G3X952 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Zkscan2G3X952 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Zkscan2G3X952 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Zkscan2G3X952 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Zkscan2G3X952 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Zkscan2G3X952 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Zkscan2G3X952 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Zkscan2G3X952 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Zkscan2G3X952 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Zkscan2G3X952 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Zkscan2G3X952 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Zkscan2G3X952 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Zkscan2G3X952 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Zkscan2G3X952 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Zkscan2G3X952 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Zkscan2G3X952 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Zkscan2G3X952 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Zkscan2G3X952 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Zkscan2G3X952 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Zkscan2G3X952 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Zkscan2G3X952 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Zkscan2G3X952 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Zkscan2G3X952 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Zkscan2G3X952 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Zkscan2G3X952 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Zkscan2G3X952 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Zkscan2G3X952 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Zkscan2G3X952 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Zkscan2G3X952 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Zkscan2G3X952 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Zkscan2G3X952 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Zkscan2G3X952 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Zkscan2G3X952 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Zkscan2G3X952 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Zkscan2G3X952 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Zkscan2G3X952 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Zkscan2G3X952 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Zkscan2G3X952 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Zkscan2G3X952 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Zkscan2G3X952 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Zkscan2G3X952 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Zkscan2G3X952 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Zkscan2G3X952 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Zkscan2G3X952 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Zkscan2G3X952 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Zkscan2G3X952 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Zkscan2G3X952 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Zkscan2G3X952 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Zkscan2G3X952 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Zkscan2G3X952 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Zkscan2G3X952 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Zkscan2G3X952 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Zkscan2G3X952 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Zkscan2G3X952 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Zkscan2G3X952 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Zkscan2G3X952 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Zkscan2G3X952 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Zkscan2G3X952 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Zkscan2G3X952 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Zkscan2G3X952 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Zkscan2G3X952 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Zkscan2G3X952 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Zkscan2G3X952 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Zkscan2G3X952 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Zkscan2G3X952 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Zkscan2G3X952 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Zkscan2G3X952 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Zkscan2G3X952 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Zkscan2G3X952 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Zkscan2G3X952 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Zkscan2G3X952 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Zkscan2G3X952 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Zkscan2G3X952 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Zkscan2G3X952 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Zkscan2G3X952 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Zkscan2G3X952 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Zkscan2G3X952 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Zkscan2G3X952 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Zkscan2G3X952 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Zkscan2G3X952 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Zkscan2G3X952 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Zkscan2G3X952 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Zkscan2G3X952 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Zkscan2G3X952 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Zkscan2G3X952 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Zkscan2G3X952 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Zkscan2G3X952 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Zkscan2G3X952 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Zkscan2G3X952 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Zkscan2G3X952 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Zkscan2G3X952 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Zkscan2G3X952 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Zkscan2G3X952 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Zkscan2G3X952 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Zkscan2G3X952 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms