Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ63

Vmn1r76, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r76F8VQ63 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vmn1r76F8VQ63 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Vmn1r76F8VQ63 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmn1r76F8VQ63 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vmn1r76F8VQ63 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vmn1r76F8VQ63 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vmn1r76F8VQ63 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn1r76F8VQ63 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn1r76F8VQ63 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn1r76F8VQ63 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn1r76F8VQ63 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn1r76F8VQ63 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn1r76F8VQ63 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn1r76F8VQ63 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn1r76F8VQ63 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn1r76F8VQ63 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn1r76F8VQ63 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn1r76F8VQ63 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vmn1r76F8VQ63 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Vmn1r76F8VQ63 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Vmn1r76F8VQ63 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Vmn1r76F8VQ63 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vmn1r76F8VQ63 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Vmn1r76F8VQ63 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn1r76F8VQ63 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmn1r76F8VQ63 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmn1r76F8VQ63 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmn1r76F8VQ63 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn1r76F8VQ63 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmn1r76F8VQ63 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmn1r76F8VQ63 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vmn1r76F8VQ63 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vmn1r76F8VQ63 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vmn1r76F8VQ63 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vmn1r76F8VQ63 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vmn1r76F8VQ63 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vmn1r76F8VQ63 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vmn1r76F8VQ63 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vmn1r76F8VQ63 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vmn1r76F8VQ63 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Vmn1r76F8VQ63 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vmn1r76F8VQ63 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vmn1r76F8VQ63 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Vmn1r76F8VQ63 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vmn1r76F8VQ63 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vmn1r76F8VQ63 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vmn1r76F8VQ63 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vmn1r76F8VQ63 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vmn1r76F8VQ63 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vmn1r76F8VQ63 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn1r76F8VQ63 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn1r76F8VQ63 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn1r76F8VQ63 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn1r76F8VQ63 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn1r76F8VQ63 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn1r76F8VQ63 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn1r76F8VQ63 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn1r76F8VQ63 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn1r76F8VQ63 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn1r76F8VQ63 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn1r76F8VQ63 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn1r76F8VQ63 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn1r76F8VQ63 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn1r76F8VQ63 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn1r76F8VQ63 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn1r76F8VQ63 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmn1r76F8VQ63 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmn1r76F8VQ63 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn1r76F8VQ63 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn1r76F8VQ63 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn1r76F8VQ63 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn1r76F8VQ63 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn1r76F8VQ63 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn1r76F8VQ63 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn1r76F8VQ63 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn1r76F8VQ63 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn1r76F8VQ63 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn1r76F8VQ63 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vmn1r76F8VQ63 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vmn1r76F8VQ63 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vmn1r76F8VQ63 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vmn1r76F8VQ63 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vmn1r76F8VQ63 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vmn1r76F8VQ63 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vmn1r76F8VQ63 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vmn1r76F8VQ63 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vmn1r76F8VQ63 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vmn1r76F8VQ63 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vmn1r76F8VQ63 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vmn1r76F8VQ63 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vmn1r76F8VQ63 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Vmn1r76F8VQ63 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Vmn1r76F8VQ63 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn1r76F8VQ63 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn1r76F8VQ63 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn1r76F8VQ63 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn1r76F8VQ63 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Vmn1r76F8VQ63 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Vmn1r76F8VQ63 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Vmn1r76F8VQ63 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.6 ms