Protein–RNA interactions for Protein: F8VPY8

Colca2, COLCA2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colca2F8VPY8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Colca2F8VPY8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Colca2F8VPY8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Colca2F8VPY8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Colca2F8VPY8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Colca2F8VPY8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Colca2F8VPY8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Colca2F8VPY8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Colca2F8VPY8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Colca2F8VPY8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Colca2F8VPY8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Colca2F8VPY8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Colca2F8VPY8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Colca2F8VPY8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Colca2F8VPY8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Colca2F8VPY8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Colca2F8VPY8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Colca2F8VPY8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Colca2F8VPY8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Colca2F8VPY8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Colca2F8VPY8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Colca2F8VPY8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Colca2F8VPY8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Colca2F8VPY8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Colca2F8VPY8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Colca2F8VPY8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Colca2F8VPY8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Colca2F8VPY8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Colca2F8VPY8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Colca2F8VPY8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Colca2F8VPY8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Colca2F8VPY8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Colca2F8VPY8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Colca2F8VPY8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Colca2F8VPY8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Colca2F8VPY8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Colca2F8VPY8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Colca2F8VPY8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Colca2F8VPY8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Colca2F8VPY8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Colca2F8VPY8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Colca2F8VPY8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Colca2F8VPY8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Colca2F8VPY8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Colca2F8VPY8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Colca2F8VPY8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Colca2F8VPY8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Colca2F8VPY8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Colca2F8VPY8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Colca2F8VPY8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Colca2F8VPY8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Colca2F8VPY8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Colca2F8VPY8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Colca2F8VPY8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Colca2F8VPY8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Colca2F8VPY8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Colca2F8VPY8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Colca2F8VPY8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Colca2F8VPY8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Colca2F8VPY8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Colca2F8VPY8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Colca2F8VPY8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Colca2F8VPY8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Colca2F8VPY8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Colca2F8VPY8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Colca2F8VPY8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Colca2F8VPY8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Colca2F8VPY8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Colca2F8VPY8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Colca2F8VPY8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Colca2F8VPY8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Colca2F8VPY8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Colca2F8VPY8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Colca2F8VPY8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Colca2F8VPY8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Colca2F8VPY8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Colca2F8VPY8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Colca2F8VPY8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Colca2F8VPY8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Colca2F8VPY8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Colca2F8VPY8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Colca2F8VPY8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Colca2F8VPY8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Colca2F8VPY8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Colca2F8VPY8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Colca2F8VPY8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Colca2F8VPY8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Colca2F8VPY8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Colca2F8VPY8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Colca2F8VPY8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Colca2F8VPY8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Colca2F8VPY8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Colca2F8VPY8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Colca2F8VPY8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Colca2F8VPY8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Colca2F8VPY8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Colca2F8VPY8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Colca2F8VPY8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Colca2F8VPY8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Colca2F8VPY8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms