Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Farp1F8VPU2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Farp1F8VPU2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Farp1F8VPU2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Farp1F8VPU2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Farp1F8VPU2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Farp1F8VPU2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Farp1F8VPU2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Farp1F8VPU2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Farp1F8VPU2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Farp1F8VPU2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Farp1F8VPU2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Farp1F8VPU2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Farp1F8VPU2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Farp1F8VPU2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Farp1F8VPU2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Farp1F8VPU2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Farp1F8VPU2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Farp1F8VPU2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Farp1F8VPU2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Farp1F8VPU2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Farp1F8VPU2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Farp1F8VPU2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Farp1F8VPU2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Farp1F8VPU2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Farp1F8VPU2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Farp1F8VPU2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Farp1F8VPU2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Farp1F8VPU2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Farp1F8VPU2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Farp1F8VPU2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Farp1F8VPU2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Farp1F8VPU2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Farp1F8VPU2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Farp1F8VPU2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Farp1F8VPU2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Farp1F8VPU2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Farp1F8VPU2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Farp1F8VPU2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Farp1F8VPU2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Farp1F8VPU2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Farp1F8VPU2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Farp1F8VPU2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Farp1F8VPU2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Farp1F8VPU2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Farp1F8VPU2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Farp1F8VPU2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Farp1F8VPU2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Farp1F8VPU2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Farp1F8VPU2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Farp1F8VPU2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Farp1F8VPU2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Farp1F8VPU2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Farp1F8VPU2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Farp1F8VPU2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Farp1F8VPU2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Farp1F8VPU2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Farp1F8VPU2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Farp1F8VPU2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Farp1F8VPU2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Farp1F8VPU2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Farp1F8VPU2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Farp1F8VPU2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Farp1F8VPU2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Farp1F8VPU2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Farp1F8VPU2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Farp1F8VPU2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Farp1F8VPU2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Farp1F8VPU2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Farp1F8VPU2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Farp1F8VPU2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Farp1F8VPU2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Farp1F8VPU2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Farp1F8VPU2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Farp1F8VPU2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Farp1F8VPU2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Farp1F8VPU2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Farp1F8VPU2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Farp1F8VPU2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Farp1F8VPU2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Farp1F8VPU2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Farp1F8VPU2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Farp1F8VPU2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Farp1F8VPU2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Farp1F8VPU2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Farp1F8VPU2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Farp1F8VPU2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Farp1F8VPU2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Farp1F8VPU2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Farp1F8VPU2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Farp1F8VPU2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Farp1F8VPU2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Farp1F8VPU2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Farp1F8VPU2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Farp1F8VPU2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Farp1F8VPU2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Farp1F8VPU2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Farp1F8VPU2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Farp1F8VPU2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Farp1F8VPU2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms