Protein–RNA interactions for Protein: F8VPN3

Gm5160, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5160F8VPN3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm5160F8VPN3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm5160F8VPN3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm5160F8VPN3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm5160F8VPN3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm5160F8VPN3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm5160F8VPN3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm5160F8VPN3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm5160F8VPN3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm5160F8VPN3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm5160F8VPN3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm5160F8VPN3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm5160F8VPN3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm5160F8VPN3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm5160F8VPN3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm5160F8VPN3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm5160F8VPN3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm5160F8VPN3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm5160F8VPN3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm5160F8VPN3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm5160F8VPN3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm5160F8VPN3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm5160F8VPN3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm5160F8VPN3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm5160F8VPN3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm5160F8VPN3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm5160F8VPN3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm5160F8VPN3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm5160F8VPN3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm5160F8VPN3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm5160F8VPN3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm5160F8VPN3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm5160F8VPN3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm5160F8VPN3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm5160F8VPN3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm5160F8VPN3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm5160F8VPN3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm5160F8VPN3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gm5160F8VPN3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm5160F8VPN3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm5160F8VPN3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm5160F8VPN3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm5160F8VPN3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm5160F8VPN3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm5160F8VPN3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm5160F8VPN3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm5160F8VPN3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm5160F8VPN3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm5160F8VPN3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm5160F8VPN3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm5160F8VPN3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm5160F8VPN3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm5160F8VPN3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm5160F8VPN3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm5160F8VPN3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm5160F8VPN3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm5160F8VPN3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm5160F8VPN3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm5160F8VPN3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gm5160F8VPN3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm5160F8VPN3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm5160F8VPN3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm5160F8VPN3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm5160F8VPN3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm5160F8VPN3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm5160F8VPN3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm5160F8VPN3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm5160F8VPN3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm5160F8VPN3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm5160F8VPN3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm5160F8VPN3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm5160F8VPN3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm5160F8VPN3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm5160F8VPN3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm5160F8VPN3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm5160F8VPN3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm5160F8VPN3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm5160F8VPN3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm5160F8VPN3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm5160F8VPN3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm5160F8VPN3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm5160F8VPN3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm5160F8VPN3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm5160F8VPN3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm5160F8VPN3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm5160F8VPN3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm5160F8VPN3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm5160F8VPN3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm5160F8VPN3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm5160F8VPN3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm5160F8VPN3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm5160F8VPN3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm5160F8VPN3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm5160F8VPN3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm5160F8VPN3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm5160F8VPN3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm5160F8VPN3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm5160F8VPN3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm5160F8VPN3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm5160F8VPN3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 214 ms