Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20538F6Z9R1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20538F6Z9R1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20538F6Z9R1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20538F6Z9R1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20538F6Z9R1 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20538F6Z9R1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20538F6Z9R1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20538F6Z9R1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm20538F6Z9R1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm20538F6Z9R1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm20538F6Z9R1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20538F6Z9R1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20538F6Z9R1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20538F6Z9R1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20538F6Z9R1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20538F6Z9R1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20538F6Z9R1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20538F6Z9R1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20538F6Z9R1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20538F6Z9R1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20538F6Z9R1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20538F6Z9R1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20538F6Z9R1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20538F6Z9R1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20538F6Z9R1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20538F6Z9R1 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20538F6Z9R1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20538F6Z9R1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20538F6Z9R1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20538F6Z9R1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20538F6Z9R1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20538F6Z9R1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20538F6Z9R1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20538F6Z9R1 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20538F6Z9R1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20538F6Z9R1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20538F6Z9R1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20538F6Z9R1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20538F6Z9R1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20538F6Z9R1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20538F6Z9R1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20538F6Z9R1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20538F6Z9R1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20538F6Z9R1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20538F6Z9R1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20538F6Z9R1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20538F6Z9R1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20538F6Z9R1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm20538F6Z9R1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm20538F6Z9R1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20538F6Z9R1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20538F6Z9R1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20538F6Z9R1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20538F6Z9R1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20538F6Z9R1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20538F6Z9R1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20538F6Z9R1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20538F6Z9R1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20538F6Z9R1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20538F6Z9R1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20538F6Z9R1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20538F6Z9R1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20538F6Z9R1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20538F6Z9R1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20538F6Z9R1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20538F6Z9R1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20538F6Z9R1 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20538F6Z9R1 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20538F6Z9R1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20538F6Z9R1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20538F6Z9R1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20538F6Z9R1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20538F6Z9R1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20538F6Z9R1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20538F6Z9R1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20538F6Z9R1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20538F6Z9R1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20538F6Z9R1 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20538F6Z9R1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20538F6Z9R1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20538F6Z9R1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20538F6Z9R1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20538F6Z9R1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20538F6Z9R1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20538F6Z9R1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20538F6Z9R1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20538F6Z9R1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20538F6Z9R1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20538F6Z9R1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20538F6Z9R1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20538F6Z9R1 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20538F6Z9R1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20538F6Z9R1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20538F6Z9R1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20538F6Z9R1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20538F6Z9R1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20538F6Z9R1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20538F6Z9R1 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20538F6Z9R1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 149.2 ms