Protein–RNA interactions for Protein: F6UCX4

Sptbn5, Spectrin beta, non-erythrocytic 5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn5F6UCX4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sptbn5F6UCX4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Sptbn5F6UCX4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Sptbn5F6UCX4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Sptbn5F6UCX4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Sptbn5F6UCX4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Sptbn5F6UCX4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Sptbn5F6UCX4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Sptbn5F6UCX4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sptbn5F6UCX4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sptbn5F6UCX4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sptbn5F6UCX4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sptbn5F6UCX4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sptbn5F6UCX4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sptbn5F6UCX4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sptbn5F6UCX4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sptbn5F6UCX4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sptbn5F6UCX4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sptbn5F6UCX4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sptbn5F6UCX4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sptbn5F6UCX4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sptbn5F6UCX4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sptbn5F6UCX4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sptbn5F6UCX4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Sptbn5F6UCX4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sptbn5F6UCX4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sptbn5F6UCX4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sptbn5F6UCX4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sptbn5F6UCX4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sptbn5F6UCX4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sptbn5F6UCX4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sptbn5F6UCX4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Sptbn5F6UCX4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Sptbn5F6UCX4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Sptbn5F6UCX4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Sptbn5F6UCX4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sptbn5F6UCX4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sptbn5F6UCX4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sptbn5F6UCX4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sptbn5F6UCX4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sptbn5F6UCX4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sptbn5F6UCX4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sptbn5F6UCX4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Sptbn5F6UCX4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sptbn5F6UCX4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Sptbn5F6UCX4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sptbn5F6UCX4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sptbn5F6UCX4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sptbn5F6UCX4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sptbn5F6UCX4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sptbn5F6UCX4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sptbn5F6UCX4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sptbn5F6UCX4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sptbn5F6UCX4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sptbn5F6UCX4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sptbn5F6UCX4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sptbn5F6UCX4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sptbn5F6UCX4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sptbn5F6UCX4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Sptbn5F6UCX4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sptbn5F6UCX4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sptbn5F6UCX4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Sptbn5F6UCX4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sptbn5F6UCX4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sptbn5F6UCX4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sptbn5F6UCX4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sptbn5F6UCX4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sptbn5F6UCX4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sptbn5F6UCX4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sptbn5F6UCX4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sptbn5F6UCX4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sptbn5F6UCX4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sptbn5F6UCX4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sptbn5F6UCX4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sptbn5F6UCX4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Sptbn5F6UCX4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sptbn5F6UCX4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sptbn5F6UCX4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sptbn5F6UCX4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sptbn5F6UCX4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sptbn5F6UCX4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sptbn5F6UCX4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sptbn5F6UCX4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sptbn5F6UCX4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sptbn5F6UCX4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sptbn5F6UCX4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sptbn5F6UCX4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sptbn5F6UCX4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sptbn5F6UCX4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sptbn5F6UCX4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sptbn5F6UCX4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sptbn5F6UCX4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sptbn5F6UCX4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sptbn5F6UCX4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sptbn5F6UCX4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sptbn5F6UCX4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sptbn5F6UCX4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sptbn5F6UCX4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sptbn5F6UCX4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Sptbn5F6UCX4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms