Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9W7

Pdzd7, PDZ domain-containing 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd7E9Q9W7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdzd7E9Q9W7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdzd7E9Q9W7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdzd7E9Q9W7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdzd7E9Q9W7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdzd7E9Q9W7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdzd7E9Q9W7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdzd7E9Q9W7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdzd7E9Q9W7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdzd7E9Q9W7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdzd7E9Q9W7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdzd7E9Q9W7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdzd7E9Q9W7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdzd7E9Q9W7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdzd7E9Q9W7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdzd7E9Q9W7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdzd7E9Q9W7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdzd7E9Q9W7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pdzd7E9Q9W7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pdzd7E9Q9W7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdzd7E9Q9W7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdzd7E9Q9W7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdzd7E9Q9W7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdzd7E9Q9W7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdzd7E9Q9W7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdzd7E9Q9W7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdzd7E9Q9W7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdzd7E9Q9W7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdzd7E9Q9W7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdzd7E9Q9W7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdzd7E9Q9W7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pdzd7E9Q9W7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pdzd7E9Q9W7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pdzd7E9Q9W7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdzd7E9Q9W7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdzd7E9Q9W7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdzd7E9Q9W7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pdzd7E9Q9W7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdzd7E9Q9W7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdzd7E9Q9W7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdzd7E9Q9W7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pdzd7E9Q9W7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pdzd7E9Q9W7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pdzd7E9Q9W7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pdzd7E9Q9W7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pdzd7E9Q9W7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pdzd7E9Q9W7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pdzd7E9Q9W7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pdzd7E9Q9W7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pdzd7E9Q9W7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pdzd7E9Q9W7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pdzd7E9Q9W7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pdzd7E9Q9W7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pdzd7E9Q9W7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pdzd7E9Q9W7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pdzd7E9Q9W7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pdzd7E9Q9W7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Pdzd7E9Q9W7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pdzd7E9Q9W7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Pdzd7E9Q9W7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdzd7E9Q9W7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdzd7E9Q9W7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdzd7E9Q9W7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdzd7E9Q9W7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdzd7E9Q9W7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdzd7E9Q9W7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdzd7E9Q9W7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdzd7E9Q9W7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdzd7E9Q9W7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdzd7E9Q9W7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdzd7E9Q9W7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pdzd7E9Q9W7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pdzd7E9Q9W7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdzd7E9Q9W7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdzd7E9Q9W7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdzd7E9Q9W7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdzd7E9Q9W7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdzd7E9Q9W7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdzd7E9Q9W7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdzd7E9Q9W7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdzd7E9Q9W7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdzd7E9Q9W7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdzd7E9Q9W7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdzd7E9Q9W7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pdzd7E9Q9W7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pdzd7E9Q9W7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Pdzd7E9Q9W7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pdzd7E9Q9W7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdzd7E9Q9W7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdzd7E9Q9W7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdzd7E9Q9W7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdzd7E9Q9W7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdzd7E9Q9W7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdzd7E9Q9W7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdzd7E9Q9W7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdzd7E9Q9W7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pdzd7E9Q9W7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pdzd7E9Q9W7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdzd7E9Q9W7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdzd7E9Q9W7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.5 ms