Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7X7

Nrxn2, Neurexin II, mousemouse

Predictions only

Length 1,710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrxn2E9Q7X7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nrxn2E9Q7X7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nrxn2E9Q7X7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nrxn2E9Q7X7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nrxn2E9Q7X7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nrxn2E9Q7X7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Nrxn2E9Q7X7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Nrxn2E9Q7X7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Nrxn2E9Q7X7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Nrxn2E9Q7X7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Nrxn2E9Q7X7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Nrxn2E9Q7X7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Nrxn2E9Q7X7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nrxn2E9Q7X7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nrxn2E9Q7X7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nrxn2E9Q7X7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nrxn2E9Q7X7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nrxn2E9Q7X7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nrxn2E9Q7X7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nrxn2E9Q7X7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nrxn2E9Q7X7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nrxn2E9Q7X7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nrxn2E9Q7X7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Nrxn2E9Q7X7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nrxn2E9Q7X7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Nrxn2E9Q7X7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nrxn2E9Q7X7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nrxn2E9Q7X7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nrxn2E9Q7X7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nrxn2E9Q7X7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nrxn2E9Q7X7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nrxn2E9Q7X7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nrxn2E9Q7X7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nrxn2E9Q7X7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nrxn2E9Q7X7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nrxn2E9Q7X7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nrxn2E9Q7X7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nrxn2E9Q7X7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nrxn2E9Q7X7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nrxn2E9Q7X7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nrxn2E9Q7X7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nrxn2E9Q7X7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nrxn2E9Q7X7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nrxn2E9Q7X7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nrxn2E9Q7X7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nrxn2E9Q7X7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nrxn2E9Q7X7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Nrxn2E9Q7X7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nrxn2E9Q7X7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Nrxn2E9Q7X7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nrxn2E9Q7X7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nrxn2E9Q7X7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nrxn2E9Q7X7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nrxn2E9Q7X7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nrxn2E9Q7X7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nrxn2E9Q7X7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nrxn2E9Q7X7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nrxn2E9Q7X7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Nrxn2E9Q7X7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Nrxn2E9Q7X7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Nrxn2E9Q7X7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Nrxn2E9Q7X7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Nrxn2E9Q7X7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nrxn2E9Q7X7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nrxn2E9Q7X7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Nrxn2E9Q7X7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Nrxn2E9Q7X7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nrxn2E9Q7X7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nrxn2E9Q7X7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nrxn2E9Q7X7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nrxn2E9Q7X7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nrxn2E9Q7X7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nrxn2E9Q7X7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nrxn2E9Q7X7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nrxn2E9Q7X7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nrxn2E9Q7X7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nrxn2E9Q7X7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nrxn2E9Q7X7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nrxn2E9Q7X7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nrxn2E9Q7X7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nrxn2E9Q7X7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nrxn2E9Q7X7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nrxn2E9Q7X7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Nrxn2E9Q7X7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nrxn2E9Q7X7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nrxn2E9Q7X7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nrxn2E9Q7X7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nrxn2E9Q7X7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nrxn2E9Q7X7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nrxn2E9Q7X7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nrxn2E9Q7X7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nrxn2E9Q7X7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nrxn2E9Q7X7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nrxn2E9Q7X7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nrxn2E9Q7X7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nrxn2E9Q7X7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nrxn2E9Q7X7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nrxn2E9Q7X7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nrxn2E9Q7X7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nrxn2E9Q7X7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms