Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7N9

Dnah11, Dynein, axonemal, heavy chain 11, mousemouse

Predictions only

Length 4,488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnah11E9Q7N9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Dnah11E9Q7N9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Dnah11E9Q7N9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Dnah11E9Q7N9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Dnah11E9Q7N9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dnah11E9Q7N9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dnah11E9Q7N9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dnah11E9Q7N9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dnah11E9Q7N9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnah11E9Q7N9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnah11E9Q7N9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnah11E9Q7N9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnah11E9Q7N9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnah11E9Q7N9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnah11E9Q7N9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnah11E9Q7N9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnah11E9Q7N9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnah11E9Q7N9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnah11E9Q7N9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnah11E9Q7N9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnah11E9Q7N9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnah11E9Q7N9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnah11E9Q7N9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnah11E9Q7N9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnah11E9Q7N9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnah11E9Q7N9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnah11E9Q7N9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnah11E9Q7N9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnah11E9Q7N9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnah11E9Q7N9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnah11E9Q7N9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnah11E9Q7N9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnah11E9Q7N9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnah11E9Q7N9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnah11E9Q7N9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnah11E9Q7N9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnah11E9Q7N9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnah11E9Q7N9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnah11E9Q7N9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnah11E9Q7N9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnah11E9Q7N9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnah11E9Q7N9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnah11E9Q7N9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnah11E9Q7N9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnah11E9Q7N9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnah11E9Q7N9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnah11E9Q7N9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnah11E9Q7N9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnah11E9Q7N9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnah11E9Q7N9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnah11E9Q7N9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnah11E9Q7N9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnah11E9Q7N9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnah11E9Q7N9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnah11E9Q7N9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnah11E9Q7N9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnah11E9Q7N9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnah11E9Q7N9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnah11E9Q7N9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnah11E9Q7N9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dnah11E9Q7N9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dnah11E9Q7N9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnah11E9Q7N9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnah11E9Q7N9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnah11E9Q7N9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnah11E9Q7N9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnah11E9Q7N9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnah11E9Q7N9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnah11E9Q7N9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnah11E9Q7N9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnah11E9Q7N9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnah11E9Q7N9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnah11E9Q7N9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Dnah11E9Q7N9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnah11E9Q7N9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnah11E9Q7N9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnah11E9Q7N9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnah11E9Q7N9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnah11E9Q7N9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnah11E9Q7N9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnah11E9Q7N9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnah11E9Q7N9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnah11E9Q7N9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnah11E9Q7N9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnah11E9Q7N9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnah11E9Q7N9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnah11E9Q7N9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnah11E9Q7N9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnah11E9Q7N9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnah11E9Q7N9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnah11E9Q7N9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnah11E9Q7N9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnah11E9Q7N9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnah11E9Q7N9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnah11E9Q7N9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dnah11E9Q7N9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dnah11E9Q7N9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dnah11E9Q7N9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnah11E9Q7N9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms