Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L6

Foxn2, Forkhead box N2, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn2E9Q7L6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Foxn2E9Q7L6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Foxn2E9Q7L6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Foxn2E9Q7L6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Foxn2E9Q7L6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Foxn2E9Q7L6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Foxn2E9Q7L6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Foxn2E9Q7L6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Foxn2E9Q7L6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Foxn2E9Q7L6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Foxn2E9Q7L6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Foxn2E9Q7L6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Foxn2E9Q7L6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Foxn2E9Q7L6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Foxn2E9Q7L6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Foxn2E9Q7L6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Foxn2E9Q7L6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Foxn2E9Q7L6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Foxn2E9Q7L6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Foxn2E9Q7L6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Foxn2E9Q7L6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Foxn2E9Q7L6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Foxn2E9Q7L6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Foxn2E9Q7L6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Foxn2E9Q7L6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Foxn2E9Q7L6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Foxn2E9Q7L6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Foxn2E9Q7L6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Foxn2E9Q7L6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Foxn2E9Q7L6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Foxn2E9Q7L6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Foxn2E9Q7L6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Foxn2E9Q7L6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Foxn2E9Q7L6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Foxn2E9Q7L6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Foxn2E9Q7L6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Foxn2E9Q7L6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Foxn2E9Q7L6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Foxn2E9Q7L6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Foxn2E9Q7L6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Foxn2E9Q7L6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Foxn2E9Q7L6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Foxn2E9Q7L6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Foxn2E9Q7L6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Foxn2E9Q7L6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Foxn2E9Q7L6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Foxn2E9Q7L6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Foxn2E9Q7L6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Foxn2E9Q7L6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Foxn2E9Q7L6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Foxn2E9Q7L6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Foxn2E9Q7L6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Foxn2E9Q7L6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Foxn2E9Q7L6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Foxn2E9Q7L6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Foxn2E9Q7L6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Foxn2E9Q7L6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Foxn2E9Q7L6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Foxn2E9Q7L6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Foxn2E9Q7L6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Foxn2E9Q7L6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Foxn2E9Q7L6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Foxn2E9Q7L6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Foxn2E9Q7L6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Foxn2E9Q7L6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Foxn2E9Q7L6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Foxn2E9Q7L6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Foxn2E9Q7L6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Foxn2E9Q7L6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Foxn2E9Q7L6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Foxn2E9Q7L6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Foxn2E9Q7L6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Foxn2E9Q7L6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Foxn2E9Q7L6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Foxn2E9Q7L6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Foxn2E9Q7L6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Foxn2E9Q7L6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Foxn2E9Q7L6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Foxn2E9Q7L6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Foxn2E9Q7L6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Foxn2E9Q7L6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Foxn2E9Q7L6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Foxn2E9Q7L6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Foxn2E9Q7L6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Foxn2E9Q7L6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Foxn2E9Q7L6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Foxn2E9Q7L6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Foxn2E9Q7L6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Foxn2E9Q7L6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Foxn2E9Q7L6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Foxn2E9Q7L6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Foxn2E9Q7L6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Foxn2E9Q7L6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Foxn2E9Q7L6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Foxn2E9Q7L6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Foxn2E9Q7L6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Foxn2E9Q7L6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Foxn2E9Q7L6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Foxn2E9Q7L6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Foxn2E9Q7L6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms