Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm20518E9Q548 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm20518E9Q548 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm20518E9Q548 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm20518E9Q548 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm20518E9Q548 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm20518E9Q548 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm20518E9Q548 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm20518E9Q548 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm20518E9Q548 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm20518E9Q548 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm20518E9Q548 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Gm20518E9Q548 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gm20518E9Q548 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm20518E9Q548 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm20518E9Q548 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm20518E9Q548 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm20518E9Q548 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm20518E9Q548 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm20518E9Q548 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm20518E9Q548 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm20518E9Q548 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm20518E9Q548 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm20518E9Q548 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm20518E9Q548 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm20518E9Q548 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm20518E9Q548 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm20518E9Q548 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm20518E9Q548 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm20518E9Q548 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm20518E9Q548 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm20518E9Q548 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm20518E9Q548 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm20518E9Q548 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm20518E9Q548 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm20518E9Q548 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm20518E9Q548 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm20518E9Q548 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm20518E9Q548 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm20518E9Q548 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm20518E9Q548 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm20518E9Q548 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm20518E9Q548 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm20518E9Q548 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm20518E9Q548 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm20518E9Q548 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm20518E9Q548 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm20518E9Q548 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm20518E9Q548 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm20518E9Q548 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm20518E9Q548 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm20518E9Q548 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm20518E9Q548 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm20518E9Q548 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm20518E9Q548 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm20518E9Q548 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm20518E9Q548 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm20518E9Q548 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm20518E9Q548 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm20518E9Q548 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm20518E9Q548 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm20518E9Q548 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm20518E9Q548 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm20518E9Q548 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm20518E9Q548 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm20518E9Q548 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm20518E9Q548 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm20518E9Q548 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm20518E9Q548 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm20518E9Q548 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm20518E9Q548 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm20518E9Q548 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm20518E9Q548 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm20518E9Q548 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm20518E9Q548 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm20518E9Q548 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm20518E9Q548 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm20518E9Q548 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm20518E9Q548 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm20518E9Q548 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm20518E9Q548 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm20518E9Q548 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm20518E9Q548 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm20518E9Q548 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm20518E9Q548 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm20518E9Q548 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm20518E9Q548 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm20518E9Q548 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm20518E9Q548 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm20518E9Q548 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm20518E9Q548 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm20518E9Q548 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm20518E9Q548 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm20518E9Q548 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm20518E9Q548 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm20518E9Q548 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm20518E9Q548 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm20518E9Q548 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm20518E9Q548 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm20518E9Q548 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms