Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ApobE9Q414 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
ApobE9Q414 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ApobE9Q414 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ApobE9Q414 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ApobE9Q414 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ApobE9Q414 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ApobE9Q414 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ApobE9Q414 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ApobE9Q414 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ApobE9Q414 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ApobE9Q414 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ApobE9Q414 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ApobE9Q414 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ApobE9Q414 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ApobE9Q414 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ApobE9Q414 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ApobE9Q414 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ApobE9Q414 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ApobE9Q414 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ApobE9Q414 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ApobE9Q414 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ApobE9Q414 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ApobE9Q414 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ApobE9Q414 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ApobE9Q414 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ApobE9Q414 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ApobE9Q414 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ApobE9Q414 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ApobE9Q414 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ApobE9Q414 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ApobE9Q414 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ApobE9Q414 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ApobE9Q414 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ApobE9Q414 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
ApobE9Q414 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ApobE9Q414 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ApobE9Q414 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ApobE9Q414 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ApobE9Q414 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ApobE9Q414 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ApobE9Q414 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ApobE9Q414 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ApobE9Q414 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ApobE9Q414 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ApobE9Q414 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ApobE9Q414 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ApobE9Q414 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ApobE9Q414 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ApobE9Q414 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ApobE9Q414 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ApobE9Q414 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ApobE9Q414 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ApobE9Q414 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ApobE9Q414 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ApobE9Q414 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ApobE9Q414 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ApobE9Q414 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ApobE9Q414 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ApobE9Q414 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ApobE9Q414 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ApobE9Q414 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ApobE9Q414 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ApobE9Q414 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ApobE9Q414 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ApobE9Q414 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ApobE9Q414 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ApobE9Q414 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ApobE9Q414 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ApobE9Q414 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ApobE9Q414 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ApobE9Q414 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ApobE9Q414 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ApobE9Q414 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ApobE9Q414 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ApobE9Q414 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ApobE9Q414 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ApobE9Q414 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ApobE9Q414 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ApobE9Q414 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ApobE9Q414 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ApobE9Q414 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ApobE9Q414 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ApobE9Q414 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ApobE9Q414 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ApobE9Q414 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ApobE9Q414 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ApobE9Q414 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ApobE9Q414 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ApobE9Q414 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ApobE9Q414 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ApobE9Q414 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ApobE9Q414 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ApobE9Q414 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ApobE9Q414 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ApobE9Q414 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ApobE9Q414 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ApobE9Q414 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ApobE9Q414 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ApobE9Q414 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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