Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc175E9PVB3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc175E9PVB3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc175E9PVB3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc175E9PVB3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc175E9PVB3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc175E9PVB3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc175E9PVB3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc175E9PVB3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc175E9PVB3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc175E9PVB3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc175E9PVB3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc175E9PVB3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc175E9PVB3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc175E9PVB3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc175E9PVB3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc175E9PVB3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc175E9PVB3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc175E9PVB3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc175E9PVB3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc175E9PVB3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc175E9PVB3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc175E9PVB3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc175E9PVB3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc175E9PVB3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc175E9PVB3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc175E9PVB3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc175E9PVB3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc175E9PVB3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc175E9PVB3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc175E9PVB3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc175E9PVB3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc175E9PVB3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc175E9PVB3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc175E9PVB3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc175E9PVB3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc175E9PVB3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc175E9PVB3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc175E9PVB3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc175E9PVB3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc175E9PVB3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc175E9PVB3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc175E9PVB3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc175E9PVB3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc175E9PVB3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc175E9PVB3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ccdc175E9PVB3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc175E9PVB3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc175E9PVB3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc175E9PVB3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc175E9PVB3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc175E9PVB3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc175E9PVB3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc175E9PVB3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc175E9PVB3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc175E9PVB3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc175E9PVB3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc175E9PVB3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc175E9PVB3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc175E9PVB3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc175E9PVB3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc175E9PVB3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc175E9PVB3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc175E9PVB3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc175E9PVB3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc175E9PVB3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc175E9PVB3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc175E9PVB3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc175E9PVB3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc175E9PVB3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc175E9PVB3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc175E9PVB3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc175E9PVB3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc175E9PVB3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc175E9PVB3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc175E9PVB3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc175E9PVB3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc175E9PVB3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc175E9PVB3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc175E9PVB3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc175E9PVB3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc175E9PVB3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc175E9PVB3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc175E9PVB3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc175E9PVB3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc175E9PVB3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc175E9PVB3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc175E9PVB3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc175E9PVB3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc175E9PVB3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc175E9PVB3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc175E9PVB3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc175E9PVB3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc175E9PVB3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc175E9PVB3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc175E9PVB3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc175E9PVB3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc175E9PVB3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc175E9PVB3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc175E9PVB3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms