Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL5

Prrt2, Proline-rich transmembrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt2E9PUL5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prrt2E9PUL5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prrt2E9PUL5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prrt2E9PUL5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Prrt2E9PUL5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Prrt2E9PUL5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Prrt2E9PUL5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Prrt2E9PUL5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prrt2E9PUL5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prrt2E9PUL5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prrt2E9PUL5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prrt2E9PUL5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prrt2E9PUL5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Prrt2E9PUL5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Prrt2E9PUL5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Prrt2E9PUL5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prrt2E9PUL5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prrt2E9PUL5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prrt2E9PUL5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Prrt2E9PUL5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prrt2E9PUL5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prrt2E9PUL5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prrt2E9PUL5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prrt2E9PUL5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prrt2E9PUL5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prrt2E9PUL5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Prrt2E9PUL5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prrt2E9PUL5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prrt2E9PUL5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Prrt2E9PUL5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Prrt2E9PUL5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prrt2E9PUL5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prrt2E9PUL5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Prrt2E9PUL5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Prrt2E9PUL5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Prrt2E9PUL5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Prrt2E9PUL5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Prrt2E9PUL5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Prrt2E9PUL5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Prrt2E9PUL5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prrt2E9PUL5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prrt2E9PUL5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prrt2E9PUL5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prrt2E9PUL5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Prrt2E9PUL5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Prrt2E9PUL5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prrt2E9PUL5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prrt2E9PUL5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prrt2E9PUL5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Prrt2E9PUL5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Prrt2E9PUL5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Prrt2E9PUL5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Prrt2E9PUL5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Prrt2E9PUL5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Prrt2E9PUL5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Prrt2E9PUL5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prrt2E9PUL5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prrt2E9PUL5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Prrt2E9PUL5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prrt2E9PUL5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prrt2E9PUL5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prrt2E9PUL5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prrt2E9PUL5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prrt2E9PUL5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prrt2E9PUL5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prrt2E9PUL5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prrt2E9PUL5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prrt2E9PUL5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Prrt2E9PUL5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prrt2E9PUL5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prrt2E9PUL5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prrt2E9PUL5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Prrt2E9PUL5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Prrt2E9PUL5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Prrt2E9PUL5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Prrt2E9PUL5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Prrt2E9PUL5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Prrt2E9PUL5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Prrt2E9PUL5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Prrt2E9PUL5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Prrt2E9PUL5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Prrt2E9PUL5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Prrt2E9PUL5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Prrt2E9PUL5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Prrt2E9PUL5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Prrt2E9PUL5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Prrt2E9PUL5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Prrt2E9PUL5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Prrt2E9PUL5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Prrt2E9PUL5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Prrt2E9PUL5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Prrt2E9PUL5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Prrt2E9PUL5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Prrt2E9PUL5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Prrt2E9PUL5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Prrt2E9PUL5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Prrt2E9PUL5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Prrt2E9PUL5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Prrt2E9PUL5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Prrt2E9PUL5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms