Protein–RNA interactions for Protein: D3Z623

9330159F19Rik, MCG7194, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9330159F19RikD3Z623 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
9330159F19RikD3Z623 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
9330159F19RikD3Z623 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
9330159F19RikD3Z623 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
9330159F19RikD3Z623 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
9330159F19RikD3Z623 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
9330159F19RikD3Z623 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
9330159F19RikD3Z623 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
9330159F19RikD3Z623 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
9330159F19RikD3Z623 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
9330159F19RikD3Z623 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
9330159F19RikD3Z623 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
9330159F19RikD3Z623 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
9330159F19RikD3Z623 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
9330159F19RikD3Z623 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
9330159F19RikD3Z623 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
9330159F19RikD3Z623 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
9330159F19RikD3Z623 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
9330159F19RikD3Z623 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
9330159F19RikD3Z623 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
9330159F19RikD3Z623 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
9330159F19RikD3Z623 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
9330159F19RikD3Z623 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
9330159F19RikD3Z623 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
9330159F19RikD3Z623 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
9330159F19RikD3Z623 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
9330159F19RikD3Z623 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
9330159F19RikD3Z623 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
9330159F19RikD3Z623 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
9330159F19RikD3Z623 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
9330159F19RikD3Z623 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
9330159F19RikD3Z623 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
9330159F19RikD3Z623 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
9330159F19RikD3Z623 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
9330159F19RikD3Z623 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
9330159F19RikD3Z623 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
9330159F19RikD3Z623 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
9330159F19RikD3Z623 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
9330159F19RikD3Z623 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
9330159F19RikD3Z623 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
9330159F19RikD3Z623 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
9330159F19RikD3Z623 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
9330159F19RikD3Z623 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
9330159F19RikD3Z623 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
9330159F19RikD3Z623 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
9330159F19RikD3Z623 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
9330159F19RikD3Z623 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
9330159F19RikD3Z623 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
9330159F19RikD3Z623 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
9330159F19RikD3Z623 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
9330159F19RikD3Z623 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
9330159F19RikD3Z623 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
9330159F19RikD3Z623 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
9330159F19RikD3Z623 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
9330159F19RikD3Z623 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
9330159F19RikD3Z623 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
9330159F19RikD3Z623 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
9330159F19RikD3Z623 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
9330159F19RikD3Z623 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
9330159F19RikD3Z623 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
9330159F19RikD3Z623 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
9330159F19RikD3Z623 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
9330159F19RikD3Z623 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
9330159F19RikD3Z623 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
9330159F19RikD3Z623 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
9330159F19RikD3Z623 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
9330159F19RikD3Z623 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
9330159F19RikD3Z623 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
9330159F19RikD3Z623 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
9330159F19RikD3Z623 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
9330159F19RikD3Z623 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
9330159F19RikD3Z623 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
9330159F19RikD3Z623 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
9330159F19RikD3Z623 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
9330159F19RikD3Z623 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
9330159F19RikD3Z623 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
9330159F19RikD3Z623 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
9330159F19RikD3Z623 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
9330159F19RikD3Z623 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
9330159F19RikD3Z623 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
9330159F19RikD3Z623 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
9330159F19RikD3Z623 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
9330159F19RikD3Z623 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
9330159F19RikD3Z623 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
9330159F19RikD3Z623 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
9330159F19RikD3Z623 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
9330159F19RikD3Z623 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
9330159F19RikD3Z623 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
9330159F19RikD3Z623 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
9330159F19RikD3Z623 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
9330159F19RikD3Z623 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
9330159F19RikD3Z623 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
9330159F19RikD3Z623 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
9330159F19RikD3Z623 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
9330159F19RikD3Z623 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
9330159F19RikD3Z623 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
9330159F19RikD3Z623 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
9330159F19RikD3Z623 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
9330159F19RikD3Z623 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
9330159F19RikD3Z623 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms