Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5M2

Gm10110, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10110D3Z5M2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm10110D3Z5M2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm10110D3Z5M2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm10110D3Z5M2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm10110D3Z5M2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm10110D3Z5M2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm10110D3Z5M2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm10110D3Z5M2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm10110D3Z5M2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm10110D3Z5M2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm10110D3Z5M2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm10110D3Z5M2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm10110D3Z5M2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm10110D3Z5M2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm10110D3Z5M2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm10110D3Z5M2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm10110D3Z5M2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm10110D3Z5M2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm10110D3Z5M2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm10110D3Z5M2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm10110D3Z5M2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm10110D3Z5M2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm10110D3Z5M2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm10110D3Z5M2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm10110D3Z5M2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm10110D3Z5M2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm10110D3Z5M2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm10110D3Z5M2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm10110D3Z5M2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm10110D3Z5M2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm10110D3Z5M2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm10110D3Z5M2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm10110D3Z5M2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm10110D3Z5M2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm10110D3Z5M2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm10110D3Z5M2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm10110D3Z5M2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm10110D3Z5M2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm10110D3Z5M2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm10110D3Z5M2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gm10110D3Z5M2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gm10110D3Z5M2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm10110D3Z5M2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm10110D3Z5M2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm10110D3Z5M2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm10110D3Z5M2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm10110D3Z5M2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm10110D3Z5M2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm10110D3Z5M2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm10110D3Z5M2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm10110D3Z5M2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm10110D3Z5M2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm10110D3Z5M2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm10110D3Z5M2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm10110D3Z5M2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm10110D3Z5M2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm10110D3Z5M2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm10110D3Z5M2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm10110D3Z5M2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm10110D3Z5M2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm10110D3Z5M2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm10110D3Z5M2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm10110D3Z5M2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm10110D3Z5M2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm10110D3Z5M2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm10110D3Z5M2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm10110D3Z5M2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm10110D3Z5M2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm10110D3Z5M2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm10110D3Z5M2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm10110D3Z5M2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm10110D3Z5M2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm10110D3Z5M2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm10110D3Z5M2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm10110D3Z5M2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm10110D3Z5M2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm10110D3Z5M2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm10110D3Z5M2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm10110D3Z5M2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm10110D3Z5M2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm10110D3Z5M2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm10110D3Z5M2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm10110D3Z5M2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm10110D3Z5M2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm10110D3Z5M2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Gm10110D3Z5M2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm10110D3Z5M2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm10110D3Z5M2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm10110D3Z5M2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm10110D3Z5M2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm10110D3Z5M2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm10110D3Z5M2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm10110D3Z5M2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm10110D3Z5M2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm10110D3Z5M2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm10110D3Z5M2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm10110D3Z5M2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm10110D3Z5M2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm10110D3Z5M2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm10110D3Z5M2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms