Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccnb1ip1D3Z3K2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccnb1ip1D3Z3K2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccnb1ip1D3Z3K2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccnb1ip1D3Z3K2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccnb1ip1D3Z3K2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccnb1ip1D3Z3K2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccnb1ip1D3Z3K2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccnb1ip1D3Z3K2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccnb1ip1D3Z3K2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccnb1ip1D3Z3K2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccnb1ip1D3Z3K2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccnb1ip1D3Z3K2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccnb1ip1D3Z3K2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccnb1ip1D3Z3K2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccnb1ip1D3Z3K2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccnb1ip1D3Z3K2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccnb1ip1D3Z3K2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccnb1ip1D3Z3K2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccnb1ip1D3Z3K2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccnb1ip1D3Z3K2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccnb1ip1D3Z3K2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccnb1ip1D3Z3K2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccnb1ip1D3Z3K2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccnb1ip1D3Z3K2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccnb1ip1D3Z3K2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccnb1ip1D3Z3K2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccnb1ip1D3Z3K2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccnb1ip1D3Z3K2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccnb1ip1D3Z3K2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccnb1ip1D3Z3K2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccnb1ip1D3Z3K2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccnb1ip1D3Z3K2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccnb1ip1D3Z3K2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccnb1ip1D3Z3K2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccnb1ip1D3Z3K2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccnb1ip1D3Z3K2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccnb1ip1D3Z3K2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccnb1ip1D3Z3K2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccnb1ip1D3Z3K2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccnb1ip1D3Z3K2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccnb1ip1D3Z3K2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccnb1ip1D3Z3K2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccnb1ip1D3Z3K2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms