Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms