Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1D3

3425401B19Rik, RIKEN cDNA 3425401B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3425401B19RikD3Z1D3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
3425401B19RikD3Z1D3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
3425401B19RikD3Z1D3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
3425401B19RikD3Z1D3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
3425401B19RikD3Z1D3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
3425401B19RikD3Z1D3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
3425401B19RikD3Z1D3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
3425401B19RikD3Z1D3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
3425401B19RikD3Z1D3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
3425401B19RikD3Z1D3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
3425401B19RikD3Z1D3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC35.15■■■■□ 3.22
3425401B19RikD3Z1D3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
3425401B19RikD3Z1D3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
3425401B19RikD3Z1D3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
3425401B19RikD3Z1D3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
3425401B19RikD3Z1D3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
3425401B19RikD3Z1D3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
3425401B19RikD3Z1D3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
3425401B19RikD3Z1D3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
3425401B19RikD3Z1D3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
3425401B19RikD3Z1D3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
3425401B19RikD3Z1D3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
3425401B19RikD3Z1D3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
3425401B19RikD3Z1D3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
3425401B19RikD3Z1D3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
3425401B19RikD3Z1D3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
3425401B19RikD3Z1D3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC35.09■■■■□ 3.21
3425401B19RikD3Z1D3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
3425401B19RikD3Z1D3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
3425401B19RikD3Z1D3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
3425401B19RikD3Z1D3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
3425401B19RikD3Z1D3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
3425401B19RikD3Z1D3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
3425401B19RikD3Z1D3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
3425401B19RikD3Z1D3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
3425401B19RikD3Z1D3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
3425401B19RikD3Z1D3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
3425401B19RikD3Z1D3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
3425401B19RikD3Z1D3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
3425401B19RikD3Z1D3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
3425401B19RikD3Z1D3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
3425401B19RikD3Z1D3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
3425401B19RikD3Z1D3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
3425401B19RikD3Z1D3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
3425401B19RikD3Z1D3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC35.02■■■■□ 3.2
3425401B19RikD3Z1D3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
3425401B19RikD3Z1D3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
3425401B19RikD3Z1D3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
3425401B19RikD3Z1D3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
3425401B19RikD3Z1D3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
3425401B19RikD3Z1D3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
3425401B19RikD3Z1D3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
3425401B19RikD3Z1D3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
3425401B19RikD3Z1D3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
3425401B19RikD3Z1D3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
3425401B19RikD3Z1D3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
3425401B19RikD3Z1D3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
3425401B19RikD3Z1D3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
3425401B19RikD3Z1D3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
3425401B19RikD3Z1D3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
3425401B19RikD3Z1D3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC34.96■■■■□ 3.19
3425401B19RikD3Z1D3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
3425401B19RikD3Z1D3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
3425401B19RikD3Z1D3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
3425401B19RikD3Z1D3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
3425401B19RikD3Z1D3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
3425401B19RikD3Z1D3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
3425401B19RikD3Z1D3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
3425401B19RikD3Z1D3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
3425401B19RikD3Z1D3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
3425401B19RikD3Z1D3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
3425401B19RikD3Z1D3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
3425401B19RikD3Z1D3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
3425401B19RikD3Z1D3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
3425401B19RikD3Z1D3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
3425401B19RikD3Z1D3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
3425401B19RikD3Z1D3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
3425401B19RikD3Z1D3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
3425401B19RikD3Z1D3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
3425401B19RikD3Z1D3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
3425401B19RikD3Z1D3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
3425401B19RikD3Z1D3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
3425401B19RikD3Z1D3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
3425401B19RikD3Z1D3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
3425401B19RikD3Z1D3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
3425401B19RikD3Z1D3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
3425401B19RikD3Z1D3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
3425401B19RikD3Z1D3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
3425401B19RikD3Z1D3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
3425401B19RikD3Z1D3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
3425401B19RikD3Z1D3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
3425401B19RikD3Z1D3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
3425401B19RikD3Z1D3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
3425401B19RikD3Z1D3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
3425401B19RikD3Z1D3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
3425401B19RikD3Z1D3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
3425401B19RikD3Z1D3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
3425401B19RikD3Z1D3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
3425401B19RikD3Z1D3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
3425401B19RikD3Z1D3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms