Protein–RNA interactions for Protein: B8JJZ9

Zfp563, Zinc finger protein 563, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp563B8JJZ9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zfp563B8JJZ9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zfp563B8JJZ9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfp563B8JJZ9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfp563B8JJZ9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfp563B8JJZ9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfp563B8JJZ9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfp563B8JJZ9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfp563B8JJZ9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfp563B8JJZ9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfp563B8JJZ9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfp563B8JJZ9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfp563B8JJZ9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp563B8JJZ9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp563B8JJZ9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp563B8JJZ9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp563B8JJZ9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp563B8JJZ9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp563B8JJZ9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp563B8JJZ9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp563B8JJZ9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp563B8JJZ9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp563B8JJZ9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp563B8JJZ9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp563B8JJZ9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp563B8JJZ9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp563B8JJZ9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp563B8JJZ9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp563B8JJZ9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp563B8JJZ9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp563B8JJZ9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp563B8JJZ9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp563B8JJZ9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp563B8JJZ9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp563B8JJZ9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp563B8JJZ9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp563B8JJZ9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp563B8JJZ9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp563B8JJZ9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp563B8JJZ9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp563B8JJZ9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp563B8JJZ9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp563B8JJZ9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp563B8JJZ9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp563B8JJZ9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp563B8JJZ9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp563B8JJZ9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp563B8JJZ9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp563B8JJZ9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp563B8JJZ9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfp563B8JJZ9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfp563B8JJZ9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfp563B8JJZ9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfp563B8JJZ9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfp563B8JJZ9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zfp563B8JJZ9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zfp563B8JJZ9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zfp563B8JJZ9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zfp563B8JJZ9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Zfp563B8JJZ9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Zfp563B8JJZ9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Zfp563B8JJZ9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp563B8JJZ9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp563B8JJZ9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp563B8JJZ9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp563B8JJZ9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp563B8JJZ9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp563B8JJZ9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp563B8JJZ9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zfp563B8JJZ9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Zfp563B8JJZ9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zfp563B8JJZ9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zfp563B8JJZ9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Zfp563B8JJZ9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zfp563B8JJZ9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zfp563B8JJZ9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zfp563B8JJZ9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zfp563B8JJZ9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zfp563B8JJZ9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zfp563B8JJZ9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Zfp563B8JJZ9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zfp563B8JJZ9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Zfp563B8JJZ9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zfp563B8JJZ9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zfp563B8JJZ9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zfp563B8JJZ9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Zfp563B8JJZ9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Zfp563B8JJZ9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Zfp563B8JJZ9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Zfp563B8JJZ9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Zfp563B8JJZ9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zfp563B8JJZ9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zfp563B8JJZ9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zfp563B8JJZ9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zfp563B8JJZ9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zfp563B8JJZ9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zfp563B8JJZ9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zfp563B8JJZ9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zfp563B8JJZ9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zfp563B8JJZ9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms