Protein–RNA interactions for Protein: B2RV77

Gm5483, MCG130182, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5483B2RV77 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm5483B2RV77 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm5483B2RV77 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm5483B2RV77 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm5483B2RV77 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm5483B2RV77 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm5483B2RV77 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm5483B2RV77 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm5483B2RV77 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm5483B2RV77 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm5483B2RV77 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm5483B2RV77 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm5483B2RV77 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm5483B2RV77 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm5483B2RV77 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm5483B2RV77 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm5483B2RV77 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm5483B2RV77 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm5483B2RV77 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm5483B2RV77 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm5483B2RV77 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Gm5483B2RV77 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gm5483B2RV77 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm5483B2RV77 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm5483B2RV77 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm5483B2RV77 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm5483B2RV77 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm5483B2RV77 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm5483B2RV77 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm5483B2RV77 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm5483B2RV77 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm5483B2RV77 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm5483B2RV77 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm5483B2RV77 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm5483B2RV77 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm5483B2RV77 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm5483B2RV77 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm5483B2RV77 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm5483B2RV77 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm5483B2RV77 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm5483B2RV77 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm5483B2RV77 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm5483B2RV77 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm5483B2RV77 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm5483B2RV77 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm5483B2RV77 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm5483B2RV77 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm5483B2RV77 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm5483B2RV77 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm5483B2RV77 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm5483B2RV77 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm5483B2RV77 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm5483B2RV77 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm5483B2RV77 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm5483B2RV77 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm5483B2RV77 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm5483B2RV77 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm5483B2RV77 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm5483B2RV77 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm5483B2RV77 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm5483B2RV77 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm5483B2RV77 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm5483B2RV77 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm5483B2RV77 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm5483B2RV77 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm5483B2RV77 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm5483B2RV77 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm5483B2RV77 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm5483B2RV77 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm5483B2RV77 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm5483B2RV77 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm5483B2RV77 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm5483B2RV77 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm5483B2RV77 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm5483B2RV77 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm5483B2RV77 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm5483B2RV77 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm5483B2RV77 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm5483B2RV77 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gm5483B2RV77 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm5483B2RV77 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm5483B2RV77 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm5483B2RV77 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm5483B2RV77 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm5483B2RV77 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm5483B2RV77 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm5483B2RV77 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm5483B2RV77 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm5483B2RV77 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm5483B2RV77 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm5483B2RV77 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm5483B2RV77 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm5483B2RV77 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm5483B2RV77 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm5483B2RV77 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm5483B2RV77 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm5483B2RV77 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm5483B2RV77 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm5483B2RV77 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm5483B2RV77 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms