Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE4

Znf518b, Zinc finger protein 518B, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518bB2RRE4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Znf518bB2RRE4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Znf518bB2RRE4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Znf518bB2RRE4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Znf518bB2RRE4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Znf518bB2RRE4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Znf518bB2RRE4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Znf518bB2RRE4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Znf518bB2RRE4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Znf518bB2RRE4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Znf518bB2RRE4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Znf518bB2RRE4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Znf518bB2RRE4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Znf518bB2RRE4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Znf518bB2RRE4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Znf518bB2RRE4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Znf518bB2RRE4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Znf518bB2RRE4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Znf518bB2RRE4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Znf518bB2RRE4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Znf518bB2RRE4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Znf518bB2RRE4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Znf518bB2RRE4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Znf518bB2RRE4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Znf518bB2RRE4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Znf518bB2RRE4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Znf518bB2RRE4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Znf518bB2RRE4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Znf518bB2RRE4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Znf518bB2RRE4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Znf518bB2RRE4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Znf518bB2RRE4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Znf518bB2RRE4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Znf518bB2RRE4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Znf518bB2RRE4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Znf518bB2RRE4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Znf518bB2RRE4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Znf518bB2RRE4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Znf518bB2RRE4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Znf518bB2RRE4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Znf518bB2RRE4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Znf518bB2RRE4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Znf518bB2RRE4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Znf518bB2RRE4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Znf518bB2RRE4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Znf518bB2RRE4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Znf518bB2RRE4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Znf518bB2RRE4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Znf518bB2RRE4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Znf518bB2RRE4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Znf518bB2RRE4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Znf518bB2RRE4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Znf518bB2RRE4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Znf518bB2RRE4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Znf518bB2RRE4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Znf518bB2RRE4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Znf518bB2RRE4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Znf518bB2RRE4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Znf518bB2RRE4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Znf518bB2RRE4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Znf518bB2RRE4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Znf518bB2RRE4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Znf518bB2RRE4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Znf518bB2RRE4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Znf518bB2RRE4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Znf518bB2RRE4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Znf518bB2RRE4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Znf518bB2RRE4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Znf518bB2RRE4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Znf518bB2RRE4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Znf518bB2RRE4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Znf518bB2RRE4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Znf518bB2RRE4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Znf518bB2RRE4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Znf518bB2RRE4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Znf518bB2RRE4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Znf518bB2RRE4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Znf518bB2RRE4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Znf518bB2RRE4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Znf518bB2RRE4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Znf518bB2RRE4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Znf518bB2RRE4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Znf518bB2RRE4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Znf518bB2RRE4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Znf518bB2RRE4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Znf518bB2RRE4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Znf518bB2RRE4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Znf518bB2RRE4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Znf518bB2RRE4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Znf518bB2RRE4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Znf518bB2RRE4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Znf518bB2RRE4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Znf518bB2RRE4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Znf518bB2RRE4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Znf518bB2RRE4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Znf518bB2RRE4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Znf518bB2RRE4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Znf518bB2RRE4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Znf518bB2RRE4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Znf518bB2RRE4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms