Protein–RNA interactions for Protein: B1AUF7

1700042G07Rik, MCG1049117, mousemouse

Predictions only

Length 90 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700042G07RikB1AUF7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
1700042G07RikB1AUF7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
1700042G07RikB1AUF7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
1700042G07RikB1AUF7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
1700042G07RikB1AUF7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
1700042G07RikB1AUF7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
1700042G07RikB1AUF7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
1700042G07RikB1AUF7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
1700042G07RikB1AUF7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
1700042G07RikB1AUF7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
1700042G07RikB1AUF7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
1700042G07RikB1AUF7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
1700042G07RikB1AUF7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
1700042G07RikB1AUF7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
1700042G07RikB1AUF7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
1700042G07RikB1AUF7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
1700042G07RikB1AUF7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
1700042G07RikB1AUF7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
1700042G07RikB1AUF7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
1700042G07RikB1AUF7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
1700042G07RikB1AUF7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
1700042G07RikB1AUF7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
1700042G07RikB1AUF7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
1700042G07RikB1AUF7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
1700042G07RikB1AUF7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
1700042G07RikB1AUF7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
1700042G07RikB1AUF7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
1700042G07RikB1AUF7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
1700042G07RikB1AUF7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
1700042G07RikB1AUF7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
1700042G07RikB1AUF7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
1700042G07RikB1AUF7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
1700042G07RikB1AUF7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
1700042G07RikB1AUF7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
1700042G07RikB1AUF7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
1700042G07RikB1AUF7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
1700042G07RikB1AUF7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
1700042G07RikB1AUF7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
1700042G07RikB1AUF7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
1700042G07RikB1AUF7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
1700042G07RikB1AUF7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
1700042G07RikB1AUF7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
1700042G07RikB1AUF7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
1700042G07RikB1AUF7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
1700042G07RikB1AUF7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
1700042G07RikB1AUF7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
1700042G07RikB1AUF7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
1700042G07RikB1AUF7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
1700042G07RikB1AUF7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
1700042G07RikB1AUF7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
1700042G07RikB1AUF7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
1700042G07RikB1AUF7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
1700042G07RikB1AUF7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
1700042G07RikB1AUF7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
1700042G07RikB1AUF7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
1700042G07RikB1AUF7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
1700042G07RikB1AUF7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
1700042G07RikB1AUF7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
1700042G07RikB1AUF7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
1700042G07RikB1AUF7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
1700042G07RikB1AUF7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
1700042G07RikB1AUF7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
1700042G07RikB1AUF7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
1700042G07RikB1AUF7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
1700042G07RikB1AUF7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
1700042G07RikB1AUF7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
1700042G07RikB1AUF7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
1700042G07RikB1AUF7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
1700042G07RikB1AUF7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
1700042G07RikB1AUF7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
1700042G07RikB1AUF7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
1700042G07RikB1AUF7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
1700042G07RikB1AUF7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
1700042G07RikB1AUF7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
1700042G07RikB1AUF7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
1700042G07RikB1AUF7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
1700042G07RikB1AUF7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
1700042G07RikB1AUF7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
1700042G07RikB1AUF7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
1700042G07RikB1AUF7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
1700042G07RikB1AUF7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
1700042G07RikB1AUF7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
1700042G07RikB1AUF7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
1700042G07RikB1AUF7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
1700042G07RikB1AUF7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
1700042G07RikB1AUF7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
1700042G07RikB1AUF7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
1700042G07RikB1AUF7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
1700042G07RikB1AUF7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
1700042G07RikB1AUF7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
1700042G07RikB1AUF7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
1700042G07RikB1AUF7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
1700042G07RikB1AUF7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
1700042G07RikB1AUF7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
1700042G07RikB1AUF7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
1700042G07RikB1AUF7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
1700042G07RikB1AUF7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
1700042G07RikB1AUF7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
1700042G07RikB1AUF7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
1700042G07RikB1AUF7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms