Protein–RNA interactions for Protein: A7XV14

Skint11, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint11A7XV14 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Skint11A7XV14 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Skint11A7XV14 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Skint11A7XV14 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Skint11A7XV14 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Skint11A7XV14 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Skint11A7XV14 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Skint11A7XV14 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Skint11A7XV14 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Skint11A7XV14 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Skint11A7XV14 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Skint11A7XV14 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Skint11A7XV14 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Skint11A7XV14 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Skint11A7XV14 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Skint11A7XV14 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Skint11A7XV14 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Skint11A7XV14 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Skint11A7XV14 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Skint11A7XV14 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Skint11A7XV14 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Skint11A7XV14 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Skint11A7XV14 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Skint11A7XV14 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Skint11A7XV14 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Skint11A7XV14 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Skint11A7XV14 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Skint11A7XV14 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Skint11A7XV14 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Skint11A7XV14 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Skint11A7XV14 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Skint11A7XV14 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Skint11A7XV14 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Skint11A7XV14 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Skint11A7XV14 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Skint11A7XV14 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Skint11A7XV14 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Skint11A7XV14 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Skint11A7XV14 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Skint11A7XV14 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Skint11A7XV14 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Skint11A7XV14 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Skint11A7XV14 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Skint11A7XV14 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Skint11A7XV14 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Skint11A7XV14 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Skint11A7XV14 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Skint11A7XV14 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Skint11A7XV14 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Skint11A7XV14 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Skint11A7XV14 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Skint11A7XV14 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Skint11A7XV14 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Skint11A7XV14 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Skint11A7XV14 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Skint11A7XV14 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Skint11A7XV14 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Skint11A7XV14 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Skint11A7XV14 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Skint11A7XV14 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Skint11A7XV14 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Skint11A7XV14 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Skint11A7XV14 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Skint11A7XV14 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Skint11A7XV14 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Skint11A7XV14 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Skint11A7XV14 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Skint11A7XV14 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Skint11A7XV14 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Skint11A7XV14 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Skint11A7XV14 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Skint11A7XV14 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Skint11A7XV14 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Skint11A7XV14 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Skint11A7XV14 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Skint11A7XV14 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Skint11A7XV14 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Skint11A7XV14 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Skint11A7XV14 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Skint11A7XV14 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Skint11A7XV14 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Skint11A7XV14 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Skint11A7XV14 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Skint11A7XV14 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Skint11A7XV14 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Skint11A7XV14 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Skint11A7XV14 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Skint11A7XV14 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Skint11A7XV14 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Skint11A7XV14 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Skint11A7XV14 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Skint11A7XV14 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Skint11A7XV14 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Skint11A7XV14 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Skint11A7XV14 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Skint11A7XV14 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Skint11A7XV14 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Skint11A7XV14 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Skint11A7XV14 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Skint11A7XV14 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms