Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F4

Ttll11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll11A4Q9F4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ttll11A4Q9F4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ttll11A4Q9F4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ttll11A4Q9F4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ttll11A4Q9F4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ttll11A4Q9F4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ttll11A4Q9F4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ttll11A4Q9F4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ttll11A4Q9F4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ttll11A4Q9F4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ttll11A4Q9F4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ttll11A4Q9F4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ttll11A4Q9F4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ttll11A4Q9F4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ttll11A4Q9F4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ttll11A4Q9F4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ttll11A4Q9F4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ttll11A4Q9F4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ttll11A4Q9F4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ttll11A4Q9F4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ttll11A4Q9F4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ttll11A4Q9F4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ttll11A4Q9F4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ttll11A4Q9F4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ttll11A4Q9F4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttll11A4Q9F4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttll11A4Q9F4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttll11A4Q9F4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttll11A4Q9F4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttll11A4Q9F4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttll11A4Q9F4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttll11A4Q9F4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttll11A4Q9F4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttll11A4Q9F4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttll11A4Q9F4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttll11A4Q9F4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttll11A4Q9F4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttll11A4Q9F4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttll11A4Q9F4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttll11A4Q9F4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttll11A4Q9F4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttll11A4Q9F4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttll11A4Q9F4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttll11A4Q9F4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Ttll11A4Q9F4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttll11A4Q9F4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttll11A4Q9F4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttll11A4Q9F4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttll11A4Q9F4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttll11A4Q9F4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttll11A4Q9F4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttll11A4Q9F4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttll11A4Q9F4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttll11A4Q9F4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttll11A4Q9F4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttll11A4Q9F4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttll11A4Q9F4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttll11A4Q9F4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ttll11A4Q9F4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ttll11A4Q9F4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ttll11A4Q9F4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ttll11A4Q9F4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ttll11A4Q9F4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ttll11A4Q9F4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ttll11A4Q9F4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ttll11A4Q9F4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ttll11A4Q9F4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ttll11A4Q9F4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ttll11A4Q9F4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ttll11A4Q9F4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ttll11A4Q9F4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ttll11A4Q9F4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ttll11A4Q9F4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ttll11A4Q9F4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ttll11A4Q9F4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ttll11A4Q9F4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ttll11A4Q9F4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ttll11A4Q9F4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ttll11A4Q9F4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ttll11A4Q9F4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ttll11A4Q9F4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ttll11A4Q9F4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ttll11A4Q9F4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ttll11A4Q9F4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ttll11A4Q9F4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ttll11A4Q9F4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ttll11A4Q9F4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ttll11A4Q9F4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ttll11A4Q9F4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ttll11A4Q9F4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ttll11A4Q9F4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ttll11A4Q9F4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ttll11A4Q9F4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ttll11A4Q9F4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ttll11A4Q9F4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ttll11A4Q9F4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ttll11A4Q9F4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ttll11A4Q9F4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ttll11A4Q9F4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ttll11A4Q9F4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms