Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9E8

Ttll6, Tubulin polyglutamylase TTLL6, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll6A4Q9E8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ttll6A4Q9E8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ttll6A4Q9E8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ttll6A4Q9E8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ttll6A4Q9E8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ttll6A4Q9E8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ttll6A4Q9E8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ttll6A4Q9E8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ttll6A4Q9E8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Ttll6A4Q9E8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ttll6A4Q9E8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ttll6A4Q9E8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ttll6A4Q9E8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ttll6A4Q9E8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ttll6A4Q9E8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ttll6A4Q9E8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ttll6A4Q9E8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ttll6A4Q9E8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ttll6A4Q9E8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Ttll6A4Q9E8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ttll6A4Q9E8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ttll6A4Q9E8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ttll6A4Q9E8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ttll6A4Q9E8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ttll6A4Q9E8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ttll6A4Q9E8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ttll6A4Q9E8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ttll6A4Q9E8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ttll6A4Q9E8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ttll6A4Q9E8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ttll6A4Q9E8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ttll6A4Q9E8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Ttll6A4Q9E8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ttll6A4Q9E8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ttll6A4Q9E8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Ttll6A4Q9E8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ttll6A4Q9E8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Ttll6A4Q9E8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ttll6A4Q9E8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ttll6A4Q9E8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ttll6A4Q9E8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Ttll6A4Q9E8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ttll6A4Q9E8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ttll6A4Q9E8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Ttll6A4Q9E8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ttll6A4Q9E8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Ttll6A4Q9E8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ttll6A4Q9E8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ttll6A4Q9E8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ttll6A4Q9E8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ttll6A4Q9E8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ttll6A4Q9E8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ttll6A4Q9E8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ttll6A4Q9E8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ttll6A4Q9E8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Ttll6A4Q9E8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ttll6A4Q9E8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ttll6A4Q9E8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ttll6A4Q9E8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ttll6A4Q9E8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ttll6A4Q9E8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ttll6A4Q9E8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ttll6A4Q9E8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ttll6A4Q9E8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ttll6A4Q9E8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ttll6A4Q9E8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ttll6A4Q9E8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ttll6A4Q9E8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ttll6A4Q9E8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ttll6A4Q9E8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ttll6A4Q9E8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ttll6A4Q9E8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ttll6A4Q9E8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ttll6A4Q9E8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ttll6A4Q9E8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ttll6A4Q9E8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ttll6A4Q9E8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ttll6A4Q9E8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ttll6A4Q9E8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ttll6A4Q9E8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ttll6A4Q9E8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ttll6A4Q9E8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ttll6A4Q9E8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ttll6A4Q9E8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ttll6A4Q9E8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ttll6A4Q9E8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ttll6A4Q9E8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ttll6A4Q9E8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ttll6A4Q9E8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ttll6A4Q9E8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ttll6A4Q9E8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ttll6A4Q9E8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ttll6A4Q9E8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ttll6A4Q9E8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ttll6A4Q9E8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ttll6A4Q9E8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ttll6A4Q9E8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ttll6A4Q9E8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Ttll6A4Q9E8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ttll6A4Q9E8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 170 ms