Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF9

Ccdc9b, Coiled-coil domain-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9bA3KGF9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc9bA3KGF9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc9bA3KGF9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc9bA3KGF9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc9bA3KGF9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc9bA3KGF9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc9bA3KGF9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc9bA3KGF9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc9bA3KGF9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc9bA3KGF9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc9bA3KGF9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc9bA3KGF9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc9bA3KGF9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc9bA3KGF9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc9bA3KGF9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc9bA3KGF9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc9bA3KGF9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc9bA3KGF9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc9bA3KGF9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc9bA3KGF9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc9bA3KGF9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc9bA3KGF9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc9bA3KGF9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc9bA3KGF9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc9bA3KGF9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc9bA3KGF9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc9bA3KGF9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc9bA3KGF9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc9bA3KGF9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc9bA3KGF9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc9bA3KGF9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc9bA3KGF9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc9bA3KGF9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc9bA3KGF9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc9bA3KGF9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc9bA3KGF9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc9bA3KGF9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc9bA3KGF9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc9bA3KGF9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc9bA3KGF9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc9bA3KGF9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc9bA3KGF9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc9bA3KGF9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc9bA3KGF9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc9bA3KGF9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc9bA3KGF9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc9bA3KGF9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc9bA3KGF9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc9bA3KGF9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc9bA3KGF9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc9bA3KGF9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc9bA3KGF9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc9bA3KGF9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc9bA3KGF9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc9bA3KGF9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc9bA3KGF9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc9bA3KGF9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc9bA3KGF9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc9bA3KGF9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc9bA3KGF9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc9bA3KGF9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc9bA3KGF9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc9bA3KGF9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc9bA3KGF9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc9bA3KGF9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc9bA3KGF9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc9bA3KGF9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc9bA3KGF9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc9bA3KGF9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc9bA3KGF9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc9bA3KGF9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc9bA3KGF9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc9bA3KGF9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc9bA3KGF9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc9bA3KGF9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc9bA3KGF9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc9bA3KGF9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc9bA3KGF9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc9bA3KGF9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc9bA3KGF9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc9bA3KGF9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc9bA3KGF9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc9bA3KGF9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc9bA3KGF9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc9bA3KGF9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc9bA3KGF9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc9bA3KGF9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc9bA3KGF9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc9bA3KGF9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc9bA3KGF9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc9bA3KGF9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc9bA3KGF9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc9bA3KGF9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc9bA3KGF9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc9bA3KGF9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc9bA3KGF9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc9bA3KGF9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc9bA3KGF9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc9bA3KGF9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc9bA3KGF9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.3 ms