Protein–RNA interactions for Protein: A2ARP9

Catsper2, Cation channel sperm-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsper2A2ARP9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Catsper2A2ARP9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Catsper2A2ARP9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Catsper2A2ARP9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Catsper2A2ARP9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Catsper2A2ARP9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Catsper2A2ARP9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Catsper2A2ARP9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Catsper2A2ARP9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Catsper2A2ARP9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Catsper2A2ARP9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Catsper2A2ARP9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Catsper2A2ARP9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Catsper2A2ARP9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Catsper2A2ARP9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Catsper2A2ARP9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Catsper2A2ARP9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Catsper2A2ARP9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Catsper2A2ARP9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Catsper2A2ARP9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Catsper2A2ARP9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Catsper2A2ARP9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Catsper2A2ARP9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Catsper2A2ARP9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Catsper2A2ARP9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Catsper2A2ARP9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Catsper2A2ARP9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Catsper2A2ARP9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Catsper2A2ARP9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Catsper2A2ARP9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Catsper2A2ARP9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Catsper2A2ARP9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Catsper2A2ARP9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Catsper2A2ARP9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Catsper2A2ARP9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Catsper2A2ARP9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Catsper2A2ARP9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Catsper2A2ARP9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Catsper2A2ARP9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Catsper2A2ARP9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Catsper2A2ARP9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Catsper2A2ARP9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Catsper2A2ARP9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Catsper2A2ARP9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Catsper2A2ARP9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Catsper2A2ARP9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Catsper2A2ARP9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Catsper2A2ARP9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Catsper2A2ARP9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Catsper2A2ARP9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Catsper2A2ARP9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Catsper2A2ARP9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Catsper2A2ARP9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Catsper2A2ARP9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Catsper2A2ARP9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Catsper2A2ARP9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Catsper2A2ARP9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Catsper2A2ARP9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Catsper2A2ARP9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Catsper2A2ARP9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Catsper2A2ARP9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Catsper2A2ARP9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Catsper2A2ARP9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Catsper2A2ARP9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Catsper2A2ARP9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Catsper2A2ARP9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Catsper2A2ARP9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Catsper2A2ARP9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Catsper2A2ARP9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Catsper2A2ARP9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Catsper2A2ARP9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Catsper2A2ARP9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Catsper2A2ARP9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Catsper2A2ARP9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Catsper2A2ARP9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Catsper2A2ARP9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Catsper2A2ARP9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Catsper2A2ARP9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Catsper2A2ARP9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Catsper2A2ARP9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Catsper2A2ARP9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Catsper2A2ARP9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Catsper2A2ARP9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Catsper2A2ARP9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Catsper2A2ARP9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Catsper2A2ARP9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Catsper2A2ARP9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Catsper2A2ARP9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Catsper2A2ARP9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Catsper2A2ARP9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Catsper2A2ARP9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Catsper2A2ARP9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Catsper2A2ARP9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Catsper2A2ARP9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Catsper2A2ARP9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Catsper2A2ARP9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Catsper2A2ARP9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Catsper2A2ARP9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Catsper2A2ARP9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Catsper2A2ARP9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms