Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Rtf1A2AQ19 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
Rtf1A2AQ19 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Rtf1A2AQ19 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Rtf1A2AQ19 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Rtf1A2AQ19 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Rtf1A2AQ19 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Rtf1A2AQ19 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Rtf1A2AQ19 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Rtf1A2AQ19 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Rtf1A2AQ19 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Rtf1A2AQ19 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Rtf1A2AQ19 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Rtf1A2AQ19 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
Rtf1A2AQ19 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Rtf1A2AQ19 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Rtf1A2AQ19 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Rtf1A2AQ19 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Rtf1A2AQ19 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Rtf1A2AQ19 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Rtf1A2AQ19 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
Rtf1A2AQ19 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Rtf1A2AQ19 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Rtf1A2AQ19 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Rtf1A2AQ19 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Rtf1A2AQ19 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Rtf1A2AQ19 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Rtf1A2AQ19 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Rtf1A2AQ19 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Rtf1A2AQ19 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Rtf1A2AQ19 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Rtf1A2AQ19 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Rtf1A2AQ19 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Rtf1A2AQ19 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Rtf1A2AQ19 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
Rtf1A2AQ19 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
Rtf1A2AQ19 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Rtf1A2AQ19 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Rtf1A2AQ19 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Rtf1A2AQ19 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Rtf1A2AQ19 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Rtf1A2AQ19 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Rtf1A2AQ19 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Rtf1A2AQ19 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Rtf1A2AQ19 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Rtf1A2AQ19 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Rtf1A2AQ19 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Rtf1A2AQ19 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Rtf1A2AQ19 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Rtf1A2AQ19 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Rtf1A2AQ19 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Rtf1A2AQ19 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Rtf1A2AQ19 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Rtf1A2AQ19 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Rtf1A2AQ19 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Rtf1A2AQ19 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Rtf1A2AQ19 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Rtf1A2AQ19 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Rtf1A2AQ19 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Rtf1A2AQ19 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Rtf1A2AQ19 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Rtf1A2AQ19 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Rtf1A2AQ19 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Rtf1A2AQ19 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Rtf1A2AQ19 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Rtf1A2AQ19 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Rtf1A2AQ19 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Rtf1A2AQ19 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Rtf1A2AQ19 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Rtf1A2AQ19 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Rtf1A2AQ19 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Rtf1A2AQ19 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Rtf1A2AQ19 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Rtf1A2AQ19 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Rtf1A2AQ19 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Rtf1A2AQ19 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rtf1A2AQ19 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rtf1A2AQ19 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rtf1A2AQ19 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rtf1A2AQ19 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rtf1A2AQ19 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Rtf1A2AQ19 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Rtf1A2AQ19 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rtf1A2AQ19 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rtf1A2AQ19 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Rtf1A2AQ19 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Rtf1A2AQ19 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Rtf1A2AQ19 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rtf1A2AQ19 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rtf1A2AQ19 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rtf1A2AQ19 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rtf1A2AQ19 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rtf1A2AQ19 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rtf1A2AQ19 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rtf1A2AQ19 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Rtf1A2AQ19 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Rtf1A2AQ19 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Rtf1A2AQ19 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Rtf1A2AQ19 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rtf1A2AQ19 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
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