Protein–RNA interactions for Protein: A2AKM2

Hacd4, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 4, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd4A2AKM2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hacd4A2AKM2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hacd4A2AKM2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hacd4A2AKM2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hacd4A2AKM2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hacd4A2AKM2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hacd4A2AKM2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hacd4A2AKM2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hacd4A2AKM2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hacd4A2AKM2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hacd4A2AKM2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hacd4A2AKM2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hacd4A2AKM2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hacd4A2AKM2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hacd4A2AKM2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hacd4A2AKM2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hacd4A2AKM2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hacd4A2AKM2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hacd4A2AKM2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hacd4A2AKM2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hacd4A2AKM2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hacd4A2AKM2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hacd4A2AKM2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hacd4A2AKM2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hacd4A2AKM2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hacd4A2AKM2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hacd4A2AKM2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hacd4A2AKM2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hacd4A2AKM2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hacd4A2AKM2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hacd4A2AKM2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hacd4A2AKM2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hacd4A2AKM2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hacd4A2AKM2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hacd4A2AKM2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hacd4A2AKM2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hacd4A2AKM2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hacd4A2AKM2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hacd4A2AKM2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hacd4A2AKM2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hacd4A2AKM2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hacd4A2AKM2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hacd4A2AKM2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hacd4A2AKM2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hacd4A2AKM2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hacd4A2AKM2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hacd4A2AKM2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hacd4A2AKM2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hacd4A2AKM2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hacd4A2AKM2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hacd4A2AKM2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hacd4A2AKM2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hacd4A2AKM2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hacd4A2AKM2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hacd4A2AKM2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hacd4A2AKM2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hacd4A2AKM2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hacd4A2AKM2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hacd4A2AKM2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Hacd4A2AKM2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hacd4A2AKM2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hacd4A2AKM2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hacd4A2AKM2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hacd4A2AKM2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Hacd4A2AKM2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hacd4A2AKM2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hacd4A2AKM2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hacd4A2AKM2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hacd4A2AKM2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hacd4A2AKM2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hacd4A2AKM2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hacd4A2AKM2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hacd4A2AKM2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hacd4A2AKM2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hacd4A2AKM2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hacd4A2AKM2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hacd4A2AKM2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hacd4A2AKM2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hacd4A2AKM2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hacd4A2AKM2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Hacd4A2AKM2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hacd4A2AKM2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hacd4A2AKM2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hacd4A2AKM2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hacd4A2AKM2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hacd4A2AKM2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Hacd4A2AKM2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hacd4A2AKM2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hacd4A2AKM2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hacd4A2AKM2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hacd4A2AKM2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hacd4A2AKM2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hacd4A2AKM2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hacd4A2AKM2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hacd4A2AKM2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hacd4A2AKM2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hacd4A2AKM2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hacd4A2AKM2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hacd4A2AKM2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hacd4A2AKM2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms