Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Calcoco2A2A6M5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Calcoco2A2A6M5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Calcoco2A2A6M5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Calcoco2A2A6M5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Calcoco2A2A6M5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Calcoco2A2A6M5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Calcoco2A2A6M5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Calcoco2A2A6M5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Calcoco2A2A6M5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Calcoco2A2A6M5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Calcoco2A2A6M5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Calcoco2A2A6M5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Calcoco2A2A6M5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Calcoco2A2A6M5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Calcoco2A2A6M5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Calcoco2A2A6M5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Calcoco2A2A6M5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Calcoco2A2A6M5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Calcoco2A2A6M5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Calcoco2A2A6M5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Calcoco2A2A6M5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Calcoco2A2A6M5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Calcoco2A2A6M5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Calcoco2A2A6M5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Calcoco2A2A6M5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Calcoco2A2A6M5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Calcoco2A2A6M5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Calcoco2A2A6M5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Calcoco2A2A6M5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Calcoco2A2A6M5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Calcoco2A2A6M5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Calcoco2A2A6M5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Calcoco2A2A6M5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Calcoco2A2A6M5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Calcoco2A2A6M5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Calcoco2A2A6M5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Calcoco2A2A6M5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Calcoco2A2A6M5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Calcoco2A2A6M5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Calcoco2A2A6M5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Calcoco2A2A6M5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Calcoco2A2A6M5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Calcoco2A2A6M5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Calcoco2A2A6M5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Calcoco2A2A6M5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Calcoco2A2A6M5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Calcoco2A2A6M5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Calcoco2A2A6M5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Calcoco2A2A6M5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Calcoco2A2A6M5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Calcoco2A2A6M5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Calcoco2A2A6M5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Calcoco2A2A6M5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Calcoco2A2A6M5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Calcoco2A2A6M5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Calcoco2A2A6M5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Calcoco2A2A6M5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Calcoco2A2A6M5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Calcoco2A2A6M5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Calcoco2A2A6M5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Calcoco2A2A6M5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Calcoco2A2A6M5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Calcoco2A2A6M5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Calcoco2A2A6M5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Calcoco2A2A6M5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Calcoco2A2A6M5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Calcoco2A2A6M5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Calcoco2A2A6M5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Calcoco2A2A6M5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Calcoco2A2A6M5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Calcoco2A2A6M5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Calcoco2A2A6M5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Calcoco2A2A6M5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Calcoco2A2A6M5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Calcoco2A2A6M5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Calcoco2A2A6M5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Calcoco2A2A6M5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Calcoco2A2A6M5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Calcoco2A2A6M5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Calcoco2A2A6M5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Calcoco2A2A6M5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Calcoco2A2A6M5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Calcoco2A2A6M5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Calcoco2A2A6M5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Calcoco2A2A6M5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Calcoco2A2A6M5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Calcoco2A2A6M5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Calcoco2A2A6M5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Calcoco2A2A6M5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Calcoco2A2A6M5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Calcoco2A2A6M5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Calcoco2A2A6M5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Calcoco2A2A6M5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Calcoco2A2A6M5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Calcoco2A2A6M5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Calcoco2A2A6M5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Calcoco2A2A6M5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Calcoco2A2A6M5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Calcoco2A2A6M5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms