Protein–RNA interactions for Protein: A1Y9I9

Tomt, Transmembrane O-methyltransferase homolog, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TomtA1Y9I9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TomtA1Y9I9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TomtA1Y9I9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TomtA1Y9I9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TomtA1Y9I9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TomtA1Y9I9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TomtA1Y9I9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TomtA1Y9I9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TomtA1Y9I9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TomtA1Y9I9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TomtA1Y9I9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TomtA1Y9I9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TomtA1Y9I9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TomtA1Y9I9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TomtA1Y9I9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TomtA1Y9I9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TomtA1Y9I9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TomtA1Y9I9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TomtA1Y9I9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TomtA1Y9I9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TomtA1Y9I9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TomtA1Y9I9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TomtA1Y9I9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TomtA1Y9I9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TomtA1Y9I9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TomtA1Y9I9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TomtA1Y9I9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TomtA1Y9I9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TomtA1Y9I9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TomtA1Y9I9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TomtA1Y9I9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TomtA1Y9I9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TomtA1Y9I9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TomtA1Y9I9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TomtA1Y9I9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TomtA1Y9I9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TomtA1Y9I9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TomtA1Y9I9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TomtA1Y9I9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TomtA1Y9I9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TomtA1Y9I9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TomtA1Y9I9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TomtA1Y9I9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TomtA1Y9I9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TomtA1Y9I9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TomtA1Y9I9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TomtA1Y9I9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TomtA1Y9I9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TomtA1Y9I9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TomtA1Y9I9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TomtA1Y9I9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TomtA1Y9I9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TomtA1Y9I9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TomtA1Y9I9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TomtA1Y9I9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TomtA1Y9I9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TomtA1Y9I9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TomtA1Y9I9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TomtA1Y9I9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TomtA1Y9I9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TomtA1Y9I9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TomtA1Y9I9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TomtA1Y9I9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TomtA1Y9I9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TomtA1Y9I9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TomtA1Y9I9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TomtA1Y9I9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TomtA1Y9I9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TomtA1Y9I9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TomtA1Y9I9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TomtA1Y9I9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TomtA1Y9I9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TomtA1Y9I9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TomtA1Y9I9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TomtA1Y9I9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TomtA1Y9I9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TomtA1Y9I9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TomtA1Y9I9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TomtA1Y9I9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TomtA1Y9I9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TomtA1Y9I9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TomtA1Y9I9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TomtA1Y9I9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TomtA1Y9I9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TomtA1Y9I9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TomtA1Y9I9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TomtA1Y9I9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
TomtA1Y9I9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TomtA1Y9I9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TomtA1Y9I9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TomtA1Y9I9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TomtA1Y9I9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TomtA1Y9I9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TomtA1Y9I9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TomtA1Y9I9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TomtA1Y9I9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TomtA1Y9I9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TomtA1Y9I9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TomtA1Y9I9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TomtA1Y9I9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms