Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIT1

Ccdc194, Coiled-coil domain-containing protein 194, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc194A0A140LIT1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc194A0A140LIT1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc194A0A140LIT1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc194A0A140LIT1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc194A0A140LIT1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc194A0A140LIT1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc194A0A140LIT1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc194A0A140LIT1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc194A0A140LIT1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc194A0A140LIT1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc194A0A140LIT1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc194A0A140LIT1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc194A0A140LIT1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc194A0A140LIT1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc194A0A140LIT1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc194A0A140LIT1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc194A0A140LIT1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc194A0A140LIT1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc194A0A140LIT1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc194A0A140LIT1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc194A0A140LIT1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc194A0A140LIT1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc194A0A140LIT1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc194A0A140LIT1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc194A0A140LIT1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc194A0A140LIT1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc194A0A140LIT1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc194A0A140LIT1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc194A0A140LIT1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc194A0A140LIT1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc194A0A140LIT1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc194A0A140LIT1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc194A0A140LIT1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc194A0A140LIT1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc194A0A140LIT1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc194A0A140LIT1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc194A0A140LIT1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc194A0A140LIT1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc194A0A140LIT1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc194A0A140LIT1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc194A0A140LIT1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc194A0A140LIT1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc194A0A140LIT1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc194A0A140LIT1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc194A0A140LIT1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc194A0A140LIT1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc194A0A140LIT1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc194A0A140LIT1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc194A0A140LIT1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc194A0A140LIT1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc194A0A140LIT1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc194A0A140LIT1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc194A0A140LIT1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc194A0A140LIT1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc194A0A140LIT1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc194A0A140LIT1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc194A0A140LIT1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc194A0A140LIT1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc194A0A140LIT1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc194A0A140LIT1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc194A0A140LIT1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc194A0A140LIT1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc194A0A140LIT1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc194A0A140LIT1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc194A0A140LIT1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc194A0A140LIT1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc194A0A140LIT1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc194A0A140LIT1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc194A0A140LIT1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc194A0A140LIT1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc194A0A140LIT1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc194A0A140LIT1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc194A0A140LIT1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc194A0A140LIT1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc194A0A140LIT1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc194A0A140LIT1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc194A0A140LIT1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc194A0A140LIT1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc194A0A140LIT1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc194A0A140LIT1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc194A0A140LIT1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc194A0A140LIT1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc194A0A140LIT1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc194A0A140LIT1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc194A0A140LIT1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc194A0A140LIT1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc194A0A140LIT1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc194A0A140LIT1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc194A0A140LIT1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc194A0A140LIT1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc194A0A140LIT1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc194A0A140LIT1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc194A0A140LIT1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc194A0A140LIT1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc194A0A140LIT1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc194A0A140LIT1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc194A0A140LIT1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc194A0A140LIT1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc194A0A140LIT1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc194A0A140LIT1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms