Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1K3

B230359F08Rik, RIKEN cDNA B230359F08 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
B230359F08RikA0A0B4J1K3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
B230359F08RikA0A0B4J1K3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
B230359F08RikA0A0B4J1K3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B230359F08RikA0A0B4J1K3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B230359F08RikA0A0B4J1K3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B230359F08RikA0A0B4J1K3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
B230359F08RikA0A0B4J1K3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B230359F08RikA0A0B4J1K3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B230359F08RikA0A0B4J1K3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B230359F08RikA0A0B4J1K3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B230359F08RikA0A0B4J1K3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 158.7 ms