Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 AL359878.2-201ENST00000435531 407 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107 ms