Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 AC063950.1-201ENST00000552036 308 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
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USP35Q9P2H5 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
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USP35Q9P2H5 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 AP003733.3-201ENST00000524942 788 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 AC012417.1-201ENST00000582307 1039 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
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