Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
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SH3BP4Q9P0V3 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
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SH3BP4Q9P0V3 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 AL161729.3-201ENST00000603533 673 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
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