Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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LHX9Q9NQ69 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
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LHX9Q9NQ69 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
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LHX9Q9NQ69 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
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LHX9Q9NQ69 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.51□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC2.51□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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LHX9Q9NQ69 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
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LHX9Q9NQ69 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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LHX9Q9NQ69 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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