Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
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CLDN19Q8N6F1 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
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CLDN19Q8N6F1 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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CLDN19Q8N6F1 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
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CLDN19Q8N6F1 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
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CLDN19Q8N6F1 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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CLDN19Q8N6F1 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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CLDN19Q8N6F1 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CLDN19Q8N6F1 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CLDN19Q8N6F1 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
CLDN19Q8N6F1 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CLDN19Q8N6F1 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
CLDN19Q8N6F1 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CLDN19Q8N6F1 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CLDN19Q8N6F1 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CLDN19Q8N6F1 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CLDN19Q8N6F1 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CLDN19Q8N6F1 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CLDN19Q8N6F1 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CLDN19Q8N6F1 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
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