Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AC009237.9-201ENST00000414800 347 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AL357552.2-201ENST00000433876 353 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AC016683.1-201ENST00000446590 559 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 FAM74A1-201ENST00000465257 623 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AC023794.2-201ENST00000504891 528 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 LINC02411-203ENST00000546180 959 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AC007950.1-201ENST00000560465 615 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AC026462.3-201ENST00000565153 557 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AC073046.2-201ENST00000604756 527 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 GCSAML-204ENST00000463359 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP177-201ENST00000410122 107 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 STSP1-201ENST00000412493 1151 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AC104777.1-202ENST00000413247 774 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AC006026.3-201ENST00000454029 143 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 SNORA35.1-201ENST00000458908 128 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 RN7SL815P-201ENST00000470970 290 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 RN7SL836P-201ENST00000476140 296 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 RN7SL338P-201ENST00000481467 293 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AC012574.1-201ENST00000523874 252 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AP000880.1-201ENST00000529416 743 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AC013356.3-201ENST00000558601 584 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AC015818.3-202ENST00000579603 283 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AC068768.2-201ENST00000602352 343 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AC027506.1-201ENST00000621395 198 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AL160396.1-201ENST00000637433 575 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.9 ms