Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Q1T7F1 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Q1T7F1 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
Q1T7F1 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Q1T7F1 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Q1T7F1 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
Q1T7F1 MIR1275-201ENST00000408770 80 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Q1T7F1 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
Q1T7F1 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AL121904.1-202ENST00000416638 656 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Q1T7F1 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Q1T7F1 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Q1T7F1 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
Q1T7F1 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Q1T7F1 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Q1T7F1 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
Q1T7F1 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
Q1T7F1 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Q1T7F1 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Q1T7F1 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
Q1T7F1 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC079921.1-201ENST00000509449 946 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
Q1T7F1 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
Q1T7F1 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Q1T7F1 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Q1T7F1 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Q1T7F1 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Q1T7F1 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Q1T7F1 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Q1T7F1 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Q1T7F1 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC022001.1-201ENST00000605193 268 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Q1T7F1 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC099785.1-201ENST00000605697 437 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC008759.3-201ENST00000613300 508 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Q1T7F1 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC1.31□□□□□ -2.2
Q1T7F1 TMEM55A-206ENST00000630164 171 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
Q1T7F1 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
Q1T7F1 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
Q1T7F1 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
Q1T7F1 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
Q1T7F1 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
Q1T7F1 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC1.3□□□□□ -2.2
Q1T7F1 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Q1T7F1 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Q1T7F1 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Q1T7F1 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
Q1T7F1 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Q1T7F1 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Q1T7F1 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Q1T7F1 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Q1T7F1 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
Q1T7F1 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Q1T7F1 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Q1T7F1 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
Q1T7F1 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
Q1T7F1 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Q1T7F1 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC011242.1-201ENST00000433596 1158 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Q1T7F1 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC1.3□□□□□ -2.2
Q1T7F1 NDUFAF4P2-201ENST00000445374 520 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Q1T7F1 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Q1T7F1 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Q1T7F1 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
Q1T7F1 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
Q1T7F1 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
Q1T7F1 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
Q1T7F1 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
Q1T7F1 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
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